头动校正 参数

Realign: 由于被试在磁共振机器里面头会动，使用Realign调整朝向进行头动校正。可以在{WorkingDir}\RealignParameter\Sub_xxx:下看头动到底有多厉害。里面的rp_.txt可以看头动的数据有六列，前三列是xyz平动，后三列是xyz转动；FD_Power_.txt是用power的公式来计算的，一般推荐使用FD_Jenkinson_*.txt来衡量的。
还有一种是查看ExcludeSubjectsAccordingToMaxHeadMotion.txt来排除被试，里面有2mm，2degree；1mm，1degree；可以排除大于2mm，2degree的被试，现在一般不用这种方法。现在一般用meanFD来排除被试，在HeadMotion.csv文件里，使用excel打开就会有max或者mean motion，mean FD等等，一般使用MeanFD或者MeanFD Jenkinson在后面做统计分析的时候可能也要作为协变量。阈值一般是按照大于0.2来排除的，如果被试头动都很多但又想保留可以使用平均FD+两倍标准差的方式来做。

原文针对小动物影像，来源：原文链接