随笔分类 -  【04】Bio-Knowledge

摘要:飞行速度最快的鸟:尖尾雨燕平时飞行的速度为170千米/小时,最快时可达352.5千米/小时,堪称飞得最快的鸟。 跑得最快的鸟:鸵鸟,72千米/小时。 其他世界鸟类之最 游水最快的鸟:巴布亚企鹅,27.4千米/小时。 最小的鸟和最小的鸟卵:许多人都知道蜂鸟是世界上最小的鸟类,其实这种说法并不十分准确,因为全世界的蜂鸟有315种左右,分布于 从北美洲的阿拉斯加到南美洲的麦哲伦海峡,以及其间的众多岛屿上... 阅读全文
posted @ 2011-12-08 10:05 ACE封印 阅读(573) 评论(0) 推荐(0)
摘要:Ka/Ks与分子进化常用软件Ka/Ks 在遗传学中,Ka/Ks或者dN/dS表示的是异意替换(Ka)和同意替换(Ks)之间的比例。这个比例可以判断是否有选择压力作用于这个蛋白质编码基因。 不导致氨基酸改变的核苷酸变异我们称为同义突变,反之则称为非同义突变。一般认为,同义突变不受自然选择,而非同义突变则受到自然选择作用。在进化分析中,了解同义突变和非同义突变发生的速率是很有意义的。常用的参数有以下几种:同义突变频率(Ks)、非同义突变频率(Ka)、非同义突变率与同义突变率的比值(Ka/Ks)。如果Ka/Ks>1,则认为有正选择效应。如果Ka/Ks=1,则认为存在中性选择。如果Ka/Ks&l 阅读全文
posted @ 2011-05-17 11:20 ACE封印 阅读(8340) 评论(0) 推荐(0)
摘要:分子量 侧链结构 类 型 丙氨酸AlanineA 或 Ala 89.079CH3-脂肪族类精氨酸ArginineR 或 Arg 174.188HN=C(NH2)-NH-(CH2)3-碱性氨基酸类天冬酰胺AsparagineN 或 Asn 132.104H2N-CO-CH2-酰胺类天冬氨酸Aspartic acidD 或 Asp 133.089HOOC-CH2-酸性氨基酸类半胱氨酸CysteineC 或 Cys 121.145HS-CH2-含硫类谷氨酰胺GlutamineQ 或 Gln 146.131H2N-CO-(CH2)2-酰胺类谷氨酸Glutamic acidE 或 Glu 147.116 阅读全文
posted @ 2011-04-29 15:07 ACE封印 阅读(783) 评论(0) 推荐(0)
摘要:Modeling Nucleotide Sequence Evolution The characteristics of nucleotide sequences Four nucleotides A, C, G, T or U Ambiguity codes: S, W, R, Y, B, D, H, V, N, X Arranged in a series with directionality Some sequences are protein-coding, others are not Replicated and maintained by cellular machinery 阅读全文
posted @ 2011-04-29 15:04 ACE封印 阅读(346) 评论(0) 推荐(0)
摘要:遗传的基本单位一基因的结构及其功能 基因作为遗传的一个基本单位已经被认识多年,基因原称遗传因子,一直以一定的符号来代表,1909年,Johannsen将遗传因子称为基因。摩尔根于1926年发表的《基因论》证实,基因是位于染色体上呈直线排列的遗传单位。1941年,Beadle和Tatum在生化反应的遗传控制研究中,通过对红色链孢霉的营养缺陷型进行分析,表明基因的功能是控制酶的合成,从而提出了“一个基因一种酶”学说。1944年Avery等对肺炎双球菌的研究证明遗传物质的化学成分是脱氧核糖核酸(DNA)。1952年。Hershey证实基因由jDNA组成,1953年,Watson和Crick提出了DN 阅读全文
posted @ 2011-04-29 14:58 ACE封印 阅读(3978) 评论(0) 推荐(0)