代码改变世界

PostgreSQL中的索引(六) --(SP-GiST)

2020-08-11 21:23  abce  阅读(1634)  评论(0编辑  收藏  举报

我们已经讨论过PostgreSQL索引引擎,访问方法的接口,以及三种方法:hash index, B-tree和GiST。在本文中,我们将描述SP-GiST。

SP-GiST

首先,简单介绍一下这个名字。«GiST»部分暗示了同GiST访问方法的一些相似性。相似性确实存在:两者都是广义搜索树,为构建各种访问方法提供了框架。

«SP»代表空间分区。这里的空间通常就是我们所说的空间,例如,一个二维平面。但我们会发现,任何搜索空间,实际上都是任意值域。

SP-GiST适用于可以递归地将空间分割为不相交区域的结构。这个类包括四叉树、k维树(k-D树)和基数树(radix trees)

Structure

因此,SP-GiST访问方法的思想是将值域(value domain)分割为不重叠的子域,每个子域依次也可以分割。这样的划分导致了树的不平衡(不像b树和常规的GiST)。

不相交的特性简化了在插入和搜索时的决策。另一方面,作为规则,树是低分枝的。例如,四叉树的一个节点通常有四个子节点(与b树不同,b树的节点有数百个),而且深度更大。像这样的树很适合在RAM中工作,但索引存储在磁盘上,因此,为了减少I/O操作的数量,必须将节点打包到页中,而高效地做到这一点并不容易。此外,由于分支深度的不同,在索引中找到不同值所需的时间也会不同。

这种访问方法与GiST的方式相同,它处理低级别任务(同时访问和锁定、日志记录和纯搜索算法),并提供专门的简化接口,以支持添加对新数据类型和新分区算法的支持。

SP-GiST树的内部节点存储对子节点的引用;可以为每个引用定义一个标签。 此外,一个内部节点可以存储一个称为前缀的值。实际上,这个值不是必须的前缀;它可以看作是满足所有子节点的任意谓词。

SP-GiST的叶子节点包含索引类型的值和对表行(TID)的引用。被索引的数据本身(搜索键)可以用作值,但不是强制性的:可以存储一个缩短的值。

此外,叶子节点可以分组到列表中。因此,内部节点不仅可以引用一个值,还可以引用整个列表。

请注意,叶节点中的前缀、标签和值具有各自独立的数据类型。

与GiST相同,定义搜索的主要函数是一致性函数。对树节点调用该函数,并返回一组子节点,其值«是一致的»与搜索谓词(通常以“indexed-field operator expression”的形式)。对于叶节点,一致性函数确定该节点中的索引值是否满足搜索谓词。

搜索从根节点开始。一致性函数找出访问哪些子节点是有意义的。算法对每个找到的节点重复执行。搜索是深度优先的。

在物理层,索引节点被打包到页(page)中,以便从I/O操作的角度有效地使用节点。请注意,一个页面可以包含内部节点或叶节点,但不能同时包含这两种节点。

四叉树示例

四叉树用于索引平面上的点。一个想法是递归地将区域分割成相对于中心点的四个部分(象限)。这种树中分支的深度可以变化,并取决于适当象限中点的密度。

这是由openflights.org站点的机场扩展的演示数据库的示例,如图所示。顺便说一下,最近我们发布了一个新版本的数据库,其中我们用«point»类型的字段替换了经度和纬度。

 

首先,我们分成四个象限。

然后我们把每个象限分开

以此类推,直到我们得到最终的划分。

让我们来看在与gist相关的文章中已经考虑过的一个简单示例的更多细节。看看这种情况下的分区是什么样子的:

 

象限编号如图1所示。为了明确起见,让我们将子节点从左到右完全按照相同的顺序排列。在这种情况下,可能的索引结构如下图所示。每个内部节点最多引用4个子节点。每个引用都可以用象限号标记,如图所示。但是在实现中没有标签,因为存储一个包含四个引用的固定数组更方便,其中一些引用可以是空的。

位于边界上的点与数值较小的象限有关。

postgres=# create table points(p point);

postgres=# insert into points(p) values
  (point '(1,1)'), (point '(3,2)'), (point '(6,3)'),
  (point '(5,5)'), (point '(7,8)'), (point '(8,6)');

postgres=# create index points_quad_idx on points using spgist(p);

在本例中,默认使用«quad_point_ops»操作符类,它包含以下操作符:

postgres=# select amop.amopopr::regoperator, amop.amopstrategy
from pg_opclass opc, pg_opfamily opf, pg_am am, pg_amop amop
where opc.opcname = 'quad_point_ops'
and opf.oid = opc.opcfamily
and am.oid = opf.opfmethod
and amop.amopfamily = opc.opcfamily
and am.amname = 'spgist'
and amop.amoplefttype = opc.opcintype;
     amopopr     | amopstrategy
-----------------+--------------
 <<(point,point) |            1  strictly left
 >>(point,point) |            5  strictly right
 ~=(point,point) |            6  coincides
 <^(point,point) |           10  strictly below
 >^(point,point) |           11  strictly above
 <@(point,box)   |            8  contained in rectangle
(6 rows)

例如,让我们看看查询如何从执行select * from points where p >^ point '(2,7)'(查找给定点之上的所有点)。

我们从根节点开始,并使用一致性函数来选择要下行到的子节点。对于运算符>^,该函数将点(2,7)与节点(4,4)的中心点进行比较,并选择可能包含所寻点的象限,在本例中为第一象限和第四象限。

在第一象限对应的节点中,我们再次使用一致性函数确定子节点。中心点是(6,6),我们需要再次查看第一和第四象限。

 

叶节点列表(8,6)和(7,8)对应第一象限,其中只有(7,8)点满足查询条件。对第四象限的引用是空的。

在内部节点(4,4)中,对第四象限的引用也是空的,这样就完成了搜索。

postgres=# set enable_seqscan = off;

postgres=# explain (costs off) select * from points where p >^ point '(2,7)';
                   QUERY PLAN                  
------------------------------------------------
 Index Only Scan using points_quad_idx on points
   Index Cond: (p >^ '(2,7)'::point)
(2 rows)

原理

我们可以使用前面提到的“gevel”扩展来探究SP-GiST索引的内部结构。坏消息是,由于一个bug,这个扩展在现代版本的PostgreSQL中工作不正确。好消息是我们计划用«gevel»的功能来增强«pageinspect»(讨论)。这个错误已经在«pageinspect»中得到修复。

再一次,坏消息是补丁没有任何进展。

例如,让我们以扩展的demo数据库为例,它用于用世界地图绘制图片。

demo=# create index airports_coordinates_quad_idx on airports_ml using spgist(coordinates);

首先,我们可以得到一些索引的统计数据:

demo=# select * from spgist_stats('airports_coordinates_quad_idx');
           spgist_stats           
----------------------------------
 totalPages:        33           +
 deletedPages:      0            +
 innerPages:        3            +
 leafPages:         30           +
 emptyPages:        2            +
 usedSpace:         201.53 kbytes+
 usedInnerSpace:    2.17 kbytes  +
 usedLeafSpace:     199.36 kbytes+
 freeSpace:         61.44 kbytes +
 fillRatio:         76.64%       +
 leafTuples:        5993         +
 innerTuples:       37           +
 innerAllTheSame:   0            +
 leafPlaceholders:  725          +
 innerPlaceholders: 0            +
 leafRedirects:     0            +
 innerRedirects:    0
(1 row)

第二,我们可以输出索引树本身:

demo=# select tid, n, level, tid_ptr, prefix, leaf_value
from spgist_print('airports_coordinates_quad_idx') as t(
  tid tid,
  allthesame bool,
  n int,
  level int,
  tid_ptr tid,
  prefix point,    -- prefix type
  node_label int,  -- label type (unused here)
  leaf_value point -- list value type
)
order by tid, n;
   tid   | n | level | tid_ptr |      prefix      |    leaf_value
---------+---+-------+---------+------------------+------------------
 (1,1)   | 0 |     1 | (5,3)   | (-10.220,53.588) |
 (1,1)   | 1 |     1 | (5,2)   | (-10.220,53.588) |
 (1,1)   | 2 |     1 | (5,1)   | (-10.220,53.588) |
 (1,1)   | 3 |     1 | (5,14)  | (-10.220,53.588) |
 (3,68)  |   |     3 |         |                  | (86.107,55.270)
 (3,70)  |   |     3 |         |                  | (129.771,62.093)
 (3,85)  |   |     4 |         |                  | (57.684,-20.430)
 (3,122) |   |     4 |         |                  | (107.438,51.808)
 (3,154) |   |     3 |         |                  | (-51.678,64.191)
 (5,1)   | 0 |     2 | (24,27) | (-88.680,48.638) |
 (5,1)   | 1 |     2 | (5,7)   | (-88.680,48.638) |
 ...

但是请记住,«spgist_print»并不是输出所有的叶子值,而是只输出列表中的第一个叶子值,因此显示的是索引的结构,而不是它的全部内容。

k-dimensional(K维)树示例

对于平面上相同的点,我们也可以提出另一种划分空间的方法。

让我们通过索引的第一个点画一条水平线。它把平面分成上下两部分。要索引的第二个点属于这些部分之一。通过这一点,让我们画一条垂线,它把这部分分成两部分:右和左。我们再画一条水平线穿过下一个点,再画一条垂直线穿过下一个点,以此类推。

以这种方式构建的树的所有内部节点将只有两个子节点。这两个引用中的每一个都可以指向层次结构中的下一个内部节点,或者指向叶节点列表。

该方法易于推广到k维空间,因此在文献中也称其为k维(k-D树)。

以机场为例说明方法:

 

首先我们分成上下两部分。

 

 

然后我们把每一部分分成左右两部分

以此类推,直到我们得到最终的划分。

要像这样使用分区,我们需要在创建索引时显式地指定操作符类«kd_point_ops»。

postgres=# create index points_kd_idx on points using spgist(p kd_point_ops);

原理

在浏览树结构的时候,我们需要考虑到在这种情况下,前缀只是一个坐标而不是一个点:

demo=# select tid, n, level, tid_ptr, prefix, leaf_value
from spgist_print('airports_coordinates_kd_idx') as t(
  tid tid,
  allthesame bool,
  n int,
  level int,
  tid_ptr tid,
  prefix float,    -- prefix type
  node_label int,  -- label type (unused here)
  leaf_value point -- list node type
)
order by tid, n;
   tid   | n | level | tid_ptr |   prefix   |    leaf_value
---------+---+-------+---------+------------+------------------
 (1,1)   | 0 |     1 | (5,1)   |     53.740 |
 (1,1)   | 1 |     1 | (5,4)   |     53.740 |
 (3,113) |   |     6 |         |            | (-7.277,62.064)
 (3,114) |   |     6 |         |            | (-85.033,73.006)
 (5,1)   | 0 |     2 | (5,12)  |    -65.449 |
 (5,1)   | 1 |     2 | (5,2)   |    -65.449 |
 (5,2)   | 0 |     3 | (5,6)   |     35.624 |
 (5,2)   | 1 |     3 | (5,3)   |     35.624 |
 ...

radix树示例

我们还可以使用SP-GiST实现字符串的基数树。 基数树的思想是,要索引的字符串并不完全存储在叶节点中,而是通过将上面节点中存储的值连接到根节点来获得。

假设我们需要索引站点的url:«postgrespro.ru»、«postgrespro.com»、«postgresql.org»和«planet.postgresql.org»。

postgres=# create table sites(url text);

postgres=# insert into sites values ('postgrespro.ru'),('postgrespro.com'),('postgresql.org'),('planet.postgresql.org');

postgres=# create index on sites using spgist(url);

树的样子如下:

树存储的内部节点使用所有子节点共有的前缀。例如,在«stgres»的子节点中,值以«p»+«o»+«stgres»开始。

与四叉树不同的是,每个指向子节点的指针都另外用一个字符标记(更确切地说,用两个字节,但这不是很重要)。

«text_ops»操作符类支持类似b树的操作符:«equal»、«greater»和«less»:

postgres=# select amop.amopopr::regoperator, amop.amopstrategy
from pg_opclass opc, pg_opfamily opf, pg_am am, pg_amop amop
where opc.opcname = 'text_ops'
and opf.oid = opc.opcfamily
and am.oid = opf.opfmethod
and amop.amopfamily = opc.opcfamily
and am.amname = 'spgist'
and amop.amoplefttype = opc.opcintype;
     amopopr     | amopstrategy
-----------------+--------------
 ~<~(text,text)  |            1
 ~<=~(text,text) |            2
 =(text,text)    |            3
 ~>=~(text,text) |            4
 ~>~(text,text)  |            5
 <(text,text)    |           11
 <=(text,text)   |           12
 >=(text,text)   |           14
 >(text,text)    |           15
(9 rows)

使用波浪号的操作符的区别在于它们操作的是字节而不是字符。

有时,以基数树的形式表示可能会比b树更紧凑,因为值没有被完全存储,而是在树中往下时根据需要重新构建。

考虑一个查询:select * from sites where url like 'postgresp%ru'。可以使用索引执行:

postgres=# explain (costs off) select * from sites where url like 'postgresp%ru';
                                  QUERY PLAN                                  
------------------------------------------------------------------------------
 Index Only Scan using sites_url_idx on sites
   Index Cond: ((url ~>=~ 'postgresp'::text) AND (url ~<~ 'postgresq'::text))
   Filter: (url ~~ 'postgresp%ru'::text)
(3 rows)

实际上,索引用于查找大于或等于«postgresp»但小于«postgresq»的值(索引Cond),然后从结果中选择匹配的值(过滤器)。

首先,一致性函数必须决定我们需要下行到«p»根的哪个子节点。 有两个选项可供选择:«p»+«l»(不需要向下,即使不深入也很清楚)和«p»+«o»+«stgres»(继续向下)。

对于«stgres»节点,需要再次调用一致性函数来检查«postgres»+«p»+«ro。 »(继续向下)和«postgres»+«q»(不需要向下)。

«ro.»节点及其所有子叶节点,一致性函数将响应«yes»,因此索引方法将返回两个值:«postgrespro.com»和«postgrespro.ru»。在过滤阶段将从它们中选择一个匹配值。

 

原理

让我们看看SP-GiST访问方法的属性(查询已经在前面提供):

 amname |     name      | pg_indexam_has_property
--------+---------------+-------------------------
 spgist | can_order     | f
 spgist | can_unique    | f
 spgist | can_multi_col | f
 spgist | can_exclude   | t

SP-GiST索引不能用于排序和支持惟一约束。此外,像这样的索引不能在多个列上创建(与GiST不同)。但是允许使用这样的索引来支持排除约束。

以下是索引层可用的属性:

     name      | pg_index_has_property
---------------+-----------------------
 clusterable   | f
 index_scan    | t
 bitmap_scan   | t
 backward_scan | f

这里与GiST的区别是clusterable不支持。

最后是列层的属性:

        name        | pg_index_column_has_property 
--------------------+------------------------------
 asc                | f
 desc               | f
 nulls_first        | f
 nulls_last         | f
 orderable          | f
 distance_orderable | f
 returnable         | t
 search_array       | f
 search_nulls       | t

不支持排序,这是可预测的。到目前为止,SP-GiST中还没有用于搜索最近邻居的距离运算符。最有可能的是,这个特性将来会得到支持。

即将发布的由Nikita Glukhov发布的PostgreSQL 12补丁将支持它。

SP-GiST可用于index-only扫描,至少用于讨论过的操作符类。正如我们所看到的,在某些情况下,索引值显式存储在叶节点中,而在其他情况下,在树下降过程中,将部分地重新构建这些值。

NULLs

为了不使问题复杂化,我们到目前为止还没有提到nulls。从索引属性可以清楚地看出,支持null:

postgres=# explain (costs off)
select * from sites where url is null;
                  QUERY PLAN                  
----------------------------------------------
 Index Only Scan using sites_url_idx on sites
   Index Cond: (url IS NULL)
(2 rows)

但是,NULL对于spgist来说是陌生的。来自«spgist»操作符类的所有操作符必须是严格的:当操作符的任何参数为空时,都必须返回NULL。方法本身确保了这一点:null只是没有传递给操作符。

但是要使用仅索引扫描的访问方法,无论如何都必须将空值存储在索引中。它们被存储在一个单独的树中,有自己的根。

其他数据类型

除了点和用于字符串的基数树,其他基于SP-GiST的方法也在PostgreSQL中实现:

·«box_ops»操作符类为矩形提供了一个四叉树。 每个矩形由四维空间中的一个点表示,因此象限的数目等于16。 当矩形有很多交点时,这样的索引可以在性能上击败GiST:在GiST中不可能画出边界来将相交的对象从另一个分离,而点则没有这样的问题(甚至四维)。 ·«range_ops»操作符类为intervals提供了一个四叉树。 区间用二维点表示,下边界为横坐标,上边界为纵坐标。

 

原文地址:https://habr.com/en/company/postgrespro/blog/446624/