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2019年12月11日
使用limma、Glimma和edgeR,RNA-seq数据分析易如反掌
摘要: Contents 1 摘要 2 背景介绍 3 初始配置 4 数据整合 4.1 读入计数数据 4.2 组织样品信息 4.3 组织基因注释 5 数据预处理 5.1 原始数据尺度转换 5.2 删除低表达基因 5.3 归一化基因表达分布 5.4 对样本的无监督聚类 6 差异表达分析 6.1 创建设计矩阵和对
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posted @ 2019-12-11 09:42 沉下心学习
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2019年11月22日
在windows上安装anaconda3、python2、python3、jupyter
摘要: 1. 安装anaconda3 到官网 https://www.anaconda.com/distribution/#download-section 下载python3.7版本的anaconda3,下载完成后安装 此次下载的版本名称:Anaconda3-2019.10-Windows-x86_64.
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posted @ 2019-11-22 15:24 沉下心学习
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2019年11月20日
shell脚本书写规范
摘要: N年后的第一更,这里主要记录一些平时自己不太注意的点 1. shell脚本开头要注明解释器,并且推荐下面这种方式: 2. 一行代码太长,需要用 “\” 进行分行,看起来更美观 3. 在脚本中获取外部命令返回值的正确方式: 4. 在定义函数时,最好对函数的输入输出类型做注释 5. 一般用于外部调用的函
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posted @ 2019-11-20 15:23 沉下心学习
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2016年1月4日
Shell 的Dict
摘要: #!/bin/bashecho "shell定义字典"#必须先声明declare -A dicdic=([key1]="value1" [key2]="value2" [key3]="value3")#打印指定key的valueecho ${dic["key1"]}#打印所有key值echo ${!...
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posted @ 2016-01-04 19:49 沉下心学习
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2015年9月11日
linux shell 获取路径中指定信息
摘要: file=/home/data/hunan/hn.2015-9-11.log.bbkfile_log_name=`basename $file` ## file_log_name 就等于 hn.2015-9-11.log.bbkfile_test=`basename $file .bbk` ## f...
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posted @ 2015-09-11 14:45 沉下心学习
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2015年9月10日
压缩文件
摘要: 压缩保留源文件:gzip –c filename > filename.gz打包压缩不带路径: tar -zcfP filename.tar.gz filename(解压也要带-P)shell命令file=/home/test/class/1.logno_file_path=${file%/*} ...
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posted @ 2015-09-10 12:57 沉下心学习
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SendEmail 发邮件
摘要: 安装# wget http://caspian.dotconf.net/menu/Software/SendEmail/sendEmail-v1.56.tar.gz //下载1.56版本# tar -xzvf sendEmail-v1.56.tar.gz //解压后就可以使用了# mv sendEm...
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posted @ 2015-09-10 12:53 沉下心学习
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2015年8月31日
阿里云服务器 添加新硬盘
摘要: 今天在阿里云申请了一个最基本的Ubuntu14的云服务器,想试一下新加磁盘这里是原始的时候磁盘情况:这张是新建之后的:步骤:1. 创建云盘&挂载服务器:先在阿里云的管理控制台,选择阿里云的ESC服务器,在选择‘硬盘’,‘创建云盘’,1-5分钟创建成功后,选择新创建的云盘进行挂载服务器;2. 云服务器...
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posted @ 2015-08-31 16:35 沉下心学习
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Nginx rewrite 的 last 以及 break 的区别
摘要: last:rewrite匹配后,会再次发起一个请求,只会对location里的规则再次匹配。break:rewrite匹配后,不会发起请求,也不会匹配后面的规则。举例:location / {root html;index index.php index.html index.htm;}if ($r...
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posted @ 2015-08-31 11:00 沉下心学习
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2015年8月4日
rm 误删恢复方法
摘要: 1. 下载ext2fswget http://prdownloads.sourceforge.net/e2fsprogs/e2fsprogs-1.42.9.tar.gz2. 下载ext3grepwgethttp://ext3grep.googlecode.com/files/ext3grep-0.1...
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posted @ 2015-08-04 13:09 沉下心学习
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