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摘要： 背景： 生信中很重要的一个部分就是各种数据库（database），有名的比如Uniprot，String，Entrez Gene，GenBank等等。之后会整合这些数据库做个表格，指向不同格式的id分别来自哪些数据库。 这篇随笔介绍几个工具帮你从一种id（比如gene name，Uniprot id 阅读全文

摘要： 默认服务器已搭建，有地址有账号。 更复杂的我也不懂，当前只说自己知道的步骤。 添加远程服务器： 通过： “Tools -> Start SSH Session”，到如下页面： 填入Host（服务器地址），账户名，密码。Port一般不做更改。点OK后开始连接。 编辑服务器上文件 通过： “Tools 阅读全文

摘要： 如果是新安装的PyCharm，各种好用的包都没有，比如numpy，pandas之类。 通过： “File ->Settings ->Project: script -> Python Interpreter"， 可以查看已安装的包。 如图： 通过 “+” 号即可搜索和安装想要的包。 阅读全文

摘要： 本随笔内容包括安装，设置虚拟环境，修改路径，唤起，查看和编辑虚拟环境等。 人在海外，国内因为被墙等原因获取包的步骤不同。 安装 # Retrieve Miniconda: wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux 阅读全文

摘要： 主要是如何在linux里停止，启动，后台运行，杀进程。 以及nuhup的使用，和什么是bashrc。 在Linux里处理进程 ctrl+c 退出前台的命令 ctrl+z 挂起前台命令并暂停，返回shell ctrl+d 退出终端。如果在终端里连接了服务器，则会先log out服务器。 jobs 察看 阅读全文

摘要： 今天也是被学校服务器折腾的一天。 老师跟我说如果不是在特定服务器安装的软件可能没法在其他服务器上用，我就是懵逼状态。 安装了一个miniconda在自己的folder里，然后修改了路径使conda不指向home。 先说最近学的一些简单内容： 1. 在Linux上后台运行，处理进程。退出Termina 阅读全文