摘要： 通过本篇文章可以对ML的常用算法有个常识性的认识，没有代码，没有复杂的理论推导，就是图解一下，知道这些算法是什么，它们是怎么应用的，例子主要是分类问题。 每个算法都看了好几个视频，挑出讲的最清晰明了有趣的，便于科普。 以后有时间再对单个算法做深入地解析。 今天的算法如下： 决策树 随机森林算法 逻辑 阅读全文

摘要： 装载 作者：kicilove 来源：CSDN 原文：https://blog.csdn.net/kicilove/article/details/76060980?utm_source=copy data.table包使用总结R中的data.table包提供了一个data.frame的高级版本，让你 阅读全文

摘要： STAR 本文出自于http://www.bioinfo-scrounger.com 第一次听说START这款比对软件是因为其是ENCODE计划的御用软件，ENCODE计划(ENCyclopedia Of DNA Elements)又称人类基因组DNA元件百科全书计划，是2003年在人类基因组计划完 阅读全文

摘要： 在做分类时常常需要估算不同样本之间的相似性度量(Similarity Measurement)，这时通常采用的方法就是计算样本间的“距离”(Distance)。采用什么样的方法计算距离是很讲究，甚至关系到分类的正确与否。 本文的目的就是对常用的相似性度量作一个总结。 本文目录： 1. 欧氏距离 2. 阅读全文

摘要： 1、用0替代数据框中的缺失值NA 生成数据框： > m <- matrix(sample(c(NA, 1:10), 100, replace = TRUE), 10) > d <- as.data.frame(m) V1 V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8 V9 V10 1 4 3 NA 3 阅读全文

摘要： SYNOPSIS samtools view -bt ref_list.txt -o aln.bam aln.sam.gz samtools sort -T /tmp/aln.sorted -o aln.sorted.bam aln.bam samtools index aln.sorted.bam 阅读全文

摘要： Axt format BAM format BED format BED detail format bedGraph format barChart and bigBarChart format bigBed format bigGenePred table format bigPsl table 阅读全文

摘要： Introduction Pysam is a python module that makes it easy to read and manipulate mapped short read sequence data stored in SAM/BAM files. It is a light 阅读全文

摘要： pysam - 多种格式基因组数据（sam/bam/vcf/bcf/cram/…）读写与处理模块（python） 在开发基因组相关流程或工具时，经常需要读取、处理和创建bam、vcf、bcf 文件。目前已经有一些主流的处理此类格式文件的工具，如samtools、picard、vcftools、bcf 阅读全文

摘要： 众多周知，R语言提供了各种各样的包，方便实现我们的目的，下面给大家介绍一个可以便捷的画曼哈顿图的包：qqman install.packages(“qqman”) # 安装包 library(“qqman”) #加载包 data(package=“qqman”) #　查看qqman包中的测试数据，此 阅读全文