R 语言之数据读入与写入

本节主要介绍 Ｒ 下数据的读入与写入

读入

1. 最常用的就是 read.table(), read.csv(),查看帮助

   > help(read.table)

2. read.table 示例:

   > myData <- read.table("result.txt")
   > head(myData)
   logFC AveExpr t P.Value adj.P.Val B
   Os.8823.1.S1_at -8.51845 7.45925 -100.3200 2.11827e-13 1.21549e-08 16.9802
   OsAffx.25067.1.S1_at -7.61581 8.05295 -82.0163 1.01558e-12 2.56486e-08 16.5604
   Os.27740.1.S1_at -8.23161 7.03614 -77.0783 1.64628e-12 2.56486e-08 16.4037
   Os.43929.1.S1_s_at -8.70858 8.07308 -76.2646 1.78795e-12 2.56486e-08 16.3755
   Os.27306.1.S1_at -6.87697 6.93658 -64.5495 6.54059e-12 6.84129e-08 15.8758
   Os.26910.1.A1_at -6.01904 5.97776 -63.8100 7.15354e-12 6.84129e-08 15.8371

   对于 read.csv() 用法差不多。具体其他复杂一些的，可以查看帮助里面的各个参数。

3. 读入 Excel 格式文件:

   > install.packages("gdata") # 这个包应该很不错
   > library(gdata)
   > help(package="gdata")
   > help(read.xls)

   > myData <- read.xls("data.xls")
   WARNING: Perl module Spreadsheet::ParseXLSX cannot be loaded.
   WARNING: Microsoft Excel 2007 'XLSX' formatted files will not be processed.
   > head(myData)
   # 经检查可以正常读入 xls 格式文件，但是如上面警告，不能读入 XLSX 格式文件，理论上应该可以，但是目前还未解决。

   如果一个excel 中有不止一个 sheet, 如果想读入第二个 sheet , 可以:

   > myData <- read.xls("data.xls", sheet=2)

使用其他包去实现: 发现 "readxl" 这个包相当不错，与 "gdata" 相比，不需要 perl ，而且很好的支持 .xls 以及 .XLSX 格式,非常的专一，仅仅是完成读入。"gdata" 的其他功能更多些。

使用 "readxl" 完成Excel数据读入:

> install.packages("readxl")
> library(readxl)
> help(package="readxl")
> ?read_excel
> data <- read_excel("result.xlsx")
> data <- read_excel("result2.xls")
> data <- read_excel("result.xlsx", 2) # 2 表示读入第二个 sheet
经测试，很好用。

写入

1. 普通数据文件:

   > help(write.table) # 即可

2. 使用包 "WriteXLS" 写入 Excel (.xls OR .XLSX)

   > install.packages("WriteXLS")
   > library(WriteXLS)
   > help(package="WriteXLS")
   > ?WriteXLS
   > head(iris) # 使用Ｒ中的数据 iris
   > WriteXLS("iris", ExcelFileName="iris.xls")
   > WriteXLS("iris", ExcelFileName="iris.XLSX")

其他

还有其他一些不错的包,比如 "data.table" 可以更快的进行数据读入，比较适合大数据,有时间可以去看看.