SAMStat 的安装

安装 SAMStat

SAMStat

下载

$ wget http://downloads.sourceforge.net/project/samstat/samstat-1.5.tar.gz

解压

$ tar -xzvf samstat-1.5.tar.gz

编译

由于需要samtools ，所以如果安装过了，现保证其在 PATH 中：

$ export PATH=/home/user/samtools-1.2/bin:$PATH

开始编译

$ cd samstat-1.5/
$ ./configure
$ make

加入到 PATH 中

$ export PATH=/home/user/samstat-1.5/src/:$PATH

测试

$ samstat

应该能输出各种信息，包括版本号以及基本用法等，说明 samstat 的安装已经成功完成。