随笔分类 -  Python_script

摘要：用 python 实现如下: 1 #!/usr/bin/python 2 # Complementing DNA 3 4 my_dna = "ACTGATCGATTACGTATAGTATTTGCTATCATACATATATATCGATGCGTTCAT" 5 # 由于python 区分大小写，所以先... 阅读全文

摘要：利用 dictionary 可以将给定的cDNA序列翻译成蛋白序列 1 #!/bin/python 2 # Dictionary protein translation 3 4 my_dna = open("/home/maque/my_dna.txt").read().replace('\n',... 阅读全文

摘要：习题来源： Python for Biologists： A complete programming course for beginner 1 #!/bin/python 2 # calculate the AT content of a DNA seq 3 4 def get_at_cont... 阅读全文

摘要：给定一个序列，寻找所有的E-BOX motif (CNNTTG) , 并且将其变为小写， 用 python 实现如下： 1 #!/bin/python 2 # Date: 2015.8.01 3 # Author: 4 """ Search E-box motif(CNNTTG) in a DNA... 阅读全文

摘要：手动寻找cripsr 引物比较麻烦，而现在有些网站可以完成这一任务，但是，用python 去实现它也很简单。以下是脚本： 1 #!/usr/bin/python 2 # list all crispr-target(20 bp + NGG) 3 4 import re 5 from Bio.Seq... 阅读全文

摘要：题目来源: Conditions and Loops 1 #!/usr/bin/python3 2 # sum all odds between two positive integer 3 4 a = int(input("Please input one positive integer > ... 阅读全文

摘要：有一个文件，内容如下 file_name1 file_name4 file_name3 file_name11 file_name7 file_name1 file_name3 file_name1 file_name8 文件里有重复的名字，现想去掉重复的，只保留一个，用 python 脚本实现，代... 阅读全文