卡梅德生物:核酸适配体测序服务,SELEX 文库序列挖掘实践
在 SELEX 筛选实验完成之后,得到的核酸文库内混杂大量无效序列,传统克隆测序容易丢失部分潜在有用序列。核酸适配体测序服务依托 NGS 高通量测序结合生物信息学分析,对筛选后的文库开展序列挖掘,识别能够和靶标结合的 DNA/RNA 序列,多用于生物诊断、靶向给药以及基础科研工作。

服务工作原理
核酸适配体属于短链寡核苷酸,依靠折叠形成独特的空间结构和靶标分子结合。SELEX 技术通过多轮孵育‑洗脱‑扩增循环富集阳性序列,但筛选结束后的文库序列复杂度依旧很高。传统测序仅能解析少量克隆样本,很难还原文库真实情况。高通量测序可以实现文库全覆盖检测,再结合生信工具统计序列丰度、预测二级结构,从中筛选具备结合潜力的候选序列。
完整服务执行流程
接收 SELEX 筛选后的核酸样本后,首先做样本预处理,完成浓度、纯度与完整性检测,去除杂质与降解片段。接着构建适配短片段核酸的测序文库,完成末端修复、接头连接、纯化等操作,达到上机标准。测序下机后对原始数据做质控、去冗余、丰度统计、聚类与保守性分析,预测二级结构,剔除突变、无效序列,最后复核结果,输出完整项目报告。
可适配的实验场景
该测序分析兼容磁珠‑SELEX、Cell‑SELEX 等多种筛选方案,可处理蛋白、小分子、活细胞等不同类型靶标的文库。产出的序列资源可用于标志物筛选、靶向给药载体开发、各类传感检测开发,也支持进化分析、突变位点解析等深度定制化分析,满足基础研究和制剂开发的不同需求。
项目交付内容
交付物包含测序原始数据、质控报表、有效序列文件、序列丰度表、候选序列聚类分析结果、二级结构预测图谱以及结题报告。报告内会整理数据分析过程,并给出后续实验参考建议,便于研究人员开展后续验证实验。
SELEX 筛选后的测序与生信解析,是获取适配体候选序列的重要一环,直接影响后续验证实验的效率。卡梅德生物可以提供核酸适配体测序、SELEX 文库解析、适配体序列挖掘分析等相关技术服务,帮助科研人员推进核酸相关课题。

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