小小的米粒

摘要： library(Matrix) write(colnames(data_all), file = "Ramachandran2019_expression/baocodes.tsv",sep = "/t") write(rownames(data_all), file = "Ramachandran 阅读全文

摘要： 有些东西反直觉，你要是没想通原因，就会一直在脑子里挥之不去。 第一大反直觉的东西，在谱聚类的时候找到的最小值对应的是第二小特征值。这个实在太反直觉了，怎么最小值对应的是第二小特征值呢，太不合理了。于是就去深究一下为什么是这样。问题背景可参考这篇论文，直接进入数学部分。 如果看过问题的背景一定知道这个 阅读全文

摘要： 测序数据处理了这么多，只知道怎么测序，但是不知道怎么组装，也不知道基因是怎么定位的，好奇心都不知道去哪里了 现在被大众所知道的是基因组测序，怎么测序列已经知道了，怎么定位可以从下面的几个参考文献中了解到。 参考文献： 1、http://blog.sciencenet.cn/blog-3431904- 阅读全文

摘要： 探寻文章在呈现出来之前做了哪些尝试，是否有理论支撑 #文章解决了什么问题 数据增强。一般的数据增强是对图片进行旋转、镜像等操作，但是这篇文章采用了一种及其简单的方式：插值。但是怎么插值，其实最开始作者也是不知道的，最后尝试了多种插值方法才得到最终的结论。 #对于插值的解释 一般的数据最后网络训练出来 阅读全文

摘要： 试图揣测作者的思考方式 Landscape of Infiltrating T Cells in Liver Cancer Revealed by Single-Cell Sequencing 这篇文章[1]的一个亮点在于对肿瘤中的T细胞有了认识。 #data 不得不说，这个样本的数量和质量真的太好 阅读全文

摘要： 对于一个生物知识还停留在初中和高中时代的人来说，理解基因组数据确实有点困难，经过几天的探索，初步对这个概念有了一些理解。下面逐一解释。 #人类有显性基因和隐性基因，可是人类基因组并没有测序怎么办 人类基因组99.9%的序列都是一样的，只有少数不一样，这一部分需要对大量人群进行统计，因此诞生了数据库d 阅读全文