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2017年7月15日
Perl调用外部命令（其他脚本、系统命令）的方法和区别
摘要： 1. `command`; 使用反引号调用外部命令能够捕获其标准输出，并按行返回且每行结束处附带一个回车。反引号中的变量在编译时会被内插为其值。 2. open LIST "ls -l|"; open MORE "|more"; @list=<LIST>; print MORE @list; clo 阅读全文
posted @ 2017-07-15 17:43 马踏飞燕Beautiful 阅读(4837) 评论(0) 推荐(0)
Linux——命令
摘要： 1、pod2text # 功能输出处理对象（脚本）中的的=head1 ...=head1 ......=cut框架中的信息 2、date # 输出时间 eg: Sat Jul 15 16:32:54 CST 2017 3、command # ********* 阅读全文
posted @ 2017-07-15 16:37 马踏飞燕Beautiful 阅读(162) 评论(0) 推荐(0)
perl脚本框架整理
摘要： #开头处常用模块 #!usr/bin/perl use warnings; use strict; use Getopt::Long; use File::Basename; use PerIO::gzip; #open IN,"<:gzip","$in" or die " $in:$!"; #打开 阅读全文
posted @ 2017-07-15 15:06 马踏飞燕Beautiful 阅读(1526) 评论(0) 推荐(0)
模块——Getopt::Long接收客户命令行参数和Smart::Comments输出获得的命令行参数内容
摘要： 我们在linux常常用到一个程序需要加入参数,现在了解一下 perl 中的有关控制参数的模块 Getopt::Long ,比直接使用 @ARGV 的数组强大多了.我想大家知道在 Linux 中有的参数有二种形式. 长参数 –help 短参数 -h 也就是-和–的分别.–表示完整参数.-表示简化参数. 阅读全文
posted @ 2017-07-15 14:41 马踏飞燕Beautiful 阅读(377) 评论(0) 推荐(0)
2017年7月12日
Linux学习进阶示意图
摘要： 以上摘自：http://blog.csdn.net/zdwzzu2006/article/details/4334791 《linux就该怎么学》 http://www.csdn.net/article/a/2017-01-03/15829915 #学习路经验分享 阅读全文
posted @ 2017-07-12 10:50 马踏飞燕Beautiful 阅读(422) 评论(0) 推荐(0)
2017年7月9日
Linux——入门命令
摘要： 授课内容： 0、linux系统由来 linux各种常用命令以及对命令参数选项的熟悉： 1、目录操作命令（【跳转；查看自己当下的位置-绝对路径；查看任何路径下的目录内容】pwd(Print Working Directory);ls;cd;【创建；复制？；移动/重命名？；删除；归档；压缩；解压】mkd 阅读全文
posted @ 2017-07-09 21:20 马踏飞燕Beautiful 阅读(233) 评论(0) 推荐(0)
2017年6月7日
甲基化测序技术及其在老年疾病和衰老模型中的应用
摘要： 一、甲基化测序技术 1、12种DNA甲基化测序技术 1）什么是DNA的甲基化呢？ DNA甲基化是指针对DNA序列上的CpG岛，由甲基化转移酶将S腺苷甲硫氨酸的甲基转移给胞嘧啶。其中，5’甲基胞嘧啶(5mC) 的甲基化是一个非常重要的表观遗传学修饰事件，该事件能够调控基因活性，并影响着如细胞分化、转录 阅读全文
posted @ 2017-06-07 18:44 马踏飞燕Beautiful 阅读(1839) 评论(2) 推荐(0)
2017年5月27日
SOAPdenovo组装软件使用记录
摘要： 背景： 1、为什么要从头测序组装基因组？ 基因组是不同表型的遗传基础；获得参考基因组是深入研究一个生物体全基因组的第一步也是必须的一步；从头测序组装能够对新的测序物种构建参考基因组； 2、为什么要研究全基因组？ 确定基因组中缺失了什么；确定难以生化研究的基因和pathways；研究感兴趣的pathw 阅读全文
posted @ 2017-05-27 13:57 马踏飞燕Beautiful 阅读(8465) 评论(0) 推荐(0)
2017年5月25日
Python3学习笔记-回忆并复述是加强记忆的好方式！
摘要： http://bbs.fishc./thread-35584-1-1.html #Python好好好 操作系统：linux和mac都自带Python解释器 ->-> -> IDLE-shell命令行： dir(__builtins__) #结果中，小写单词就是内置函数bif(built-in fun 阅读全文
posted @ 2017-05-25 23:29 马踏飞燕Beautiful 阅读(488) 评论(0) 推荐(0)
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