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摘要: 大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 此前,我们分享了m6A RNA甲基化研究的数据挖掘思路(点击查看详情),进而筛选出m6A修饰目标基因。 做完MeRIP-seq测序后,如果需要对分析结果中感兴趣的内容进行后期验证,则需要进行下游实验设计。m6A RNA甲基化修饰目标基因 阅读全文
posted @ 2023-03-07 11:09 深圳市易基因科技 阅读(591) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。关于m6A甲基化研究思路(1)整体把握m6A甲基化图谱特征:m6A peak数量变化、m6A修饰基因数量变化、单个基因m6A peak数量分析、m6A peak在基因元件上的分布、m6A peak的motif分析、m6A peak修饰基因 阅读全文
posted @ 2023-03-03 13:52 深圳市易基因科技 阅读(289) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 2023年02月22日,《美国国家科学院院刊》(Proc Natl Acad Sci USA)期刊发表了题为“Conserved reduction of m6A RNA modifications during aging and n 阅读全文
posted @ 2023-03-02 11:12 深圳市易基因科技 阅读(216) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 此前,我们分享了DNA甲基化研究的测序数据挖掘思路(点击查看详情),进而鉴定出研究的目的基因或目标区域的DNA甲基化。 做完测序后,如果需要对分析结果中感兴趣的内容进行后期验证,则需要进行下游实验设计。DNA甲基化研究的后期验证包括简单 阅读全文
posted @ 2023-02-28 11:57 深圳市易基因科技 阅读(369) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 总体来说,DNA甲基化一般遵循三个步骤进行数据挖掘。 首先,进行整体全基因组甲基化变化的分析,包括平均甲基化水平变化、甲基化水平分布变化、降维分析、聚类分析、相关性分析等。 其次,进行甲基化差异水平分析,筛选具体差异基因,包括DMC/D 阅读全文
posted @ 2023-02-24 10:36 深圳市易基因科技 阅读(679) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 超级增强子(Super enhancer)是一类包含多个普通增强子的大簇,主要富集高密度的转录因子、辅助因子及增强子相关表观修饰位点。与普通增强子相比,超级增强子具有更高的转录激活能力,在细胞类型特异性发育、分化以及肿瘤的发展进程中发挥 阅读全文
posted @ 2023-02-23 11:23 深圳市易基因科技 阅读(270) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 2023年01月16日,奥地利科学院分子医学研究中心(CeMM)研究团队在《Nat Commun》杂志发表了题为“Comparative analysis of genome-scale, base-resolution DNA met 阅读全文
posted @ 2023-02-21 16:39 深圳市易基因科技 阅读(196) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 喜报:易基因组蛋白ChIP-seq研究成果见刊《Cell Reports》 2023年02月10日,沈阳农业大学植物保护学院博士研究生姚亚林为第一作者、栾军波教授为论文通讯作者在《Cell Reports》杂志以“A bacteriocyte symbiont determines whitefly 阅读全文
posted @ 2023-02-20 16:22 深圳市易基因科技 阅读(186) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 2022年05月16日,《Cancer Res》杂志发表了题为“M6A RNA Methylation Regulates Histone Ubiquitination to Support Cancer Growth and Prog 阅读全文
posted @ 2023-02-20 11:23 深圳市易基因科技 阅读(286) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 2021年10月6日,《Nat Commun》杂志发表了题为“Pig genome functional annotation enhances the biological interpretation of complex trai 阅读全文
posted @ 2023-02-09 11:47 深圳市易基因科技 阅读(289) 评论(0) 推荐(0)
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