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摘要: 大家好,这是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。今天跟大家介绍一下易基因的新产品:单细胞转录组测序(smart-seq2)。 时下火热的10X Genomics公司Chromium解决方案无法满足某些特殊或者少量细胞样本甚至单细胞转录组研究。Smart-seq2技术在单细胞水平对带Pol 阅读全文
posted @ 2023-03-17 12:07 深圳市易基因科技 阅读(489) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 此前,我们分享了染色质免疫共沉淀测序(ChIP-seq)的数据挖掘思路,进而筛选出TF结合/组蛋白修饰的目标区域和候选靶基因。 做完ChIP-seq测序后,如果需要对分析结果中感兴趣的内容进行后期验证,则需要进行下游实验设计。ChIP- 阅读全文
posted @ 2023-03-15 16:25 深圳市易基因科技 阅读(1021) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 CHIP-seq研究的数据挖掘思路主要分为3步: 整体把握CHIP-seq图谱特征:peak/reads在基因组上的分布、peak在元件上的富集、peak在基因元件上的分布、peak的motif分析、peak距离TSS位点的距离分析、p 阅读全文
posted @ 2023-03-15 14:46 深圳市易基因科技 阅读(748) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 2021年12月21日,美国阿肯色大学、德克萨斯大学和肯塔基大学的研究人员合作在《Aging Cell》杂志发表了题为“Late-life exercise mitigates skeletal muscle epigenetic ag 阅读全文
posted @ 2023-03-09 11:28 深圳市易基因科技 阅读(208) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 此前,我们分享了m6A RNA甲基化研究的数据挖掘思路(点击查看详情),进而筛选出m6A修饰目标基因。 做完MeRIP-seq测序后,如果需要对分析结果中感兴趣的内容进行后期验证,则需要进行下游实验设计。m6A RNA甲基化修饰目标基因 阅读全文
posted @ 2023-03-07 11:09 深圳市易基因科技 阅读(561) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。关于m6A甲基化研究思路(1)整体把握m6A甲基化图谱特征:m6A peak数量变化、m6A修饰基因数量变化、单个基因m6A peak数量分析、m6A peak在基因元件上的分布、m6A peak的motif分析、m6A peak修饰基因 阅读全文
posted @ 2023-03-03 13:52 深圳市易基因科技 阅读(280) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 2023年02月22日,《美国国家科学院院刊》(Proc Natl Acad Sci USA)期刊发表了题为“Conserved reduction of m6A RNA modifications during aging and n 阅读全文
posted @ 2023-03-02 11:12 深圳市易基因科技 阅读(210) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 此前,我们分享了DNA甲基化研究的测序数据挖掘思路(点击查看详情),进而鉴定出研究的目的基因或目标区域的DNA甲基化。 做完测序后,如果需要对分析结果中感兴趣的内容进行后期验证,则需要进行下游实验设计。DNA甲基化研究的后期验证包括简单 阅读全文
posted @ 2023-02-28 11:57 深圳市易基因科技 阅读(352) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 总体来说,DNA甲基化一般遵循三个步骤进行数据挖掘。 首先,进行整体全基因组甲基化变化的分析,包括平均甲基化水平变化、甲基化水平分布变化、降维分析、聚类分析、相关性分析等。 其次,进行甲基化差异水平分析,筛选具体差异基因,包括DMC/D 阅读全文
posted @ 2023-02-24 10:36 深圳市易基因科技 阅读(635) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。 超级增强子(Super enhancer)是一类包含多个普通增强子的大簇,主要富集高密度的转录因子、辅助因子及增强子相关表观修饰位点。与普通增强子相比,超级增强子具有更高的转录激活能力,在细胞类型特异性发育、分化以及肿瘤的发展进程中发挥 阅读全文
posted @ 2023-02-23 11:23 深圳市易基因科技 阅读(263) 评论(0) 推荐(0)
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