易基因:Phytomedicine/IF11.3:广东省中医院周华教授团队揭示青藤碱通过DNA甲基化缓解慢性炎症性疼痛的表观遗传镇痛机制

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因。

青藤碱(Sinomenine,SIN)是一种传统中药青风藤(Sinomenium acutum)来源的非阿片类生物碱,在临床上表现出镇痛效果,但其确切机制尚未完全阐明。

2026年8月5日,广东省中医院(广州中医药大学第二附属医院、广州中医药大学第二临床医学院、广东省中医药科学院)李奇璐博士等为第一作者、周华教授等为通讯作者,在国际权威期刊《Phytomedicine》(中科院1区Top期刊,影响因子:IF11.3)发表题为“Sinomenine alleviates chronic inflammatory pain through DNA methyltransferase 1-mediated DNA methylation of the P2X2 purinergic receptor: an epigenetic mechanism of analgesia”的高水平科研成果,揭示了青藤碱通过DNA甲基转移酶1(DNMT1)介导的P2X2嘌呤能受体DNA甲基化缓解慢性炎症性疼痛的表观遗传镇痛机制。易基因科技DNA甲基化测序技术助力揭示青藤碱通过DNMT1介导的P2X2R基因甲基化实现镇痛的分子机制。

标题:Sinomenine alleviates chronic inflammatory pain through DNA methyltransferase 1-mediated DNA methylation of the P2X2 purinergic receptor: an epigenetic mechanism of analgesia(青藤碱通过DNMT1介导的P2X2嘌呤能受体DNA甲基化缓解慢性炎症性疼痛的表观遗传镇痛机制)

发表时间:2026年8月5日

发表期刊:Phytomedicine

影响因子:IF11.3/Q1

技术平台:DNA甲基化测序等

作者单位:广东省中医院(广州中医药大学第二附属医院、广州中医药大学第二临床医学院、广东省中医药科学院)、横琴实验室

DOI:10.1016/J.Phymed.2026.158692

研究摘要

研究采用完全弗氏佐剂(CFA)诱导的大鼠慢性炎症性疼痛模型及脂多糖(LPS)刺激的BV2小胶质细胞神经炎症模型,结合行为学检测、功能检测、表观遗传学、药理学等多学科方法,揭示青藤碱通过表观遗传学机制发挥镇痛作用的全新通路。机制研究表明,SIN通过特异性上调DNA甲基转移酶1(DNMT1)表达,促进嘌呤能受体P2X2(P2X2R)基因启动子区域高甲基化,从而抑制P2X2R转录,进而抑制下游细胞外信号调控激酶1/2(ERK1/2)信号通路和钙内流,最终减轻慢性炎症性疼痛和痛觉超敏反应。该研究首次揭示了青藤碱通过上调DNMT1抑制P2X2R的转录,导致P2X2R启动子高甲基化,最终发挥镇痛作用的分子机制,这一DNMT1依赖性通路为聚焦表观遗传调控的镇痛策略提供了新的治疗靶点。

研究亮点

  • 青藤碱通过下调P2X2R缓解慢性炎症性疼痛
  • DNMT1对于青藤碱抑制P2X2R表达至关重要
  • 揭示了DNMT1调控青藤碱镇痛的新表观遗传学机制

图形摘要:青藤碱上调DNMT1诱导P2X2R启动子高甲基化及转录抑制,从而抑制P2X2R-ERK1/2信号轴,进而缓解慢性炎症性疼痛。

研究方法

动物模型:CFA诱导大鼠慢性炎症性疼痛模型,模拟人类慢性炎症性疼痛状态。

细胞模型:LPS刺激小鼠小胶质细胞(BV2细胞)系,建立体外神经炎症模型。

行为学:机械痛阈(动态足底触觉仪、von Frey纤维丝)、热痛阈(热板仪)评估疼痛行为;足容积测定仪评估足肿胀,并进行关节炎评分。

功能检测:MTT法检测细胞活力、Griess法检测一氧化氮(NO)、ELISA检测肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、Western blot检测蛋白表达、RT-qPCR检测mRNA水平、Fluo-4钙成像检测胞内Ca²⁺浓度。

表观遗传学研究:

  • 全基因组甲基化测序: MeDIP-seq全基因组甲基化谱分析。
  • 靶向重亚硫酸盐测序(Target-BS):对P2X2R基因启动子区域进行扩增子重亚硫酸盐测序(AmpBS),精确定量DNA甲基化水平变化。
  • 基因沉默:siRNA介导的DNMT1、DNMT3A、DNMT3B特异性敲低。

结果图形

(1)青藤碱缓解CFA诱导的慢性炎症性疼痛和超敏反应

图1:青藤碱(SIN)缓解CFA诱导的慢性炎症性疼痛和超敏反应。

  1. SIN化学结构。
  2. SIN对CFA处理大鼠机械痛阈的作用。
  3. SIN对CFA处理大鼠50%缩足阈值的作用。
  4. SIN对CFA处理大鼠热痛阈的作用。
  5. SIN给药后CFA处理大鼠足爪肿胀的代表性照片。
  6. SIN对CFA处理大鼠炎症评分的作用。
  7. CFA处理大鼠发炎足爪组织的代表性H-E染色图。
  8. SIN对CFA处理大鼠足爪水肿体积的作用。

(2)青藤碱通过下调P2X2R表达发挥镇痛作用


图2. 青藤碱(SIN)通过下调P2X2R表达发挥镇痛作用。
A-B. SIN对CFA处理大鼠脊髓和背根神经节(DRG)中IL-1β、TNF-αmRNA水平的作用。
C-D. SIN对CFA处理大鼠血清中炎性细胞因子IL-1β和TNF-α水平的作用。
E. SIN对CFA处理大鼠脊髓和DRG中P2X2R mRNA水平的作用。
F. SIN对CFA处理大鼠脊髓和DRG中P2X2R蛋白表达的作用。
G-H. CFA处理大鼠脊髓和DRG中P2X2R表达免疫组织化学染色的定量分析。

  1. 免疫组化染色显示CFA处理大鼠脊髓和DRG中P2X2R阳性细胞的分布。
  2. CFA处理大鼠脊髓和DRG中P2X2R蛋白的Western blot分析。
  3. 免疫组化染色显示CFA处理大鼠脊髓和DRG中P2X2R阳性细胞的分布。

(3)青藤碱在BV2细胞中缓解神经炎症反应并调控P2X2R

图3:青藤碱(SIN)在BV2细胞中缓解神经炎症反应并调控P2X2R。

  1. MTT法评估SIN对BV2细胞的细胞毒性。
  2. SIN对脂多糖(LPS)刺激的BV2细胞培养上清液中TNF-α水平的作用。
  3. SIN对LPS刺激的BV2细胞中TNF-α mRNA水平的作用。
  4. SIN对LPS刺激的BV2细胞培养上清液中一氧化氮(NO)浓度的作用。
  5. SIN对LPS刺激的BV2细胞中诱导型一氧化氮合酶(iNOS)蛋白水平的作用。
  6. SIN对LPS刺激的BV2细胞中iNOS mRNA水平的作用。
  7. SIN对LPS刺激的BV2细胞中P2X2R mRNA水平的作用。
  8. SIN对LPS刺激的BV2细胞中P2X2R蛋白水平的作用。
  9. BV2细胞中各检测蛋白的Western blot结果。

(4)青藤碱通过P2X2R/ERK1/2信号轴在体内发挥镇痛作用

图4:青藤碱(SIN)通过调控P2X2R表达,改善CFA诱导大鼠的疼痛反应及炎症信号。

  1. SIN对CFA处理大鼠机械痛阈的作用。
  2. SIN对CFA处理大鼠50%缩足阈值的作用。
  3. SIN对CFA处理大鼠热痛阈的作用。
  4. CFA处理大鼠足肿胀的代表性照片。
  5. SIN对CFA处理大鼠关节炎症评分的作用。
  6. CFA处理大鼠发炎足爪组织的H-E染色代表性图片。
  7. SIN对CFA处理大鼠足肿胀容积的作用。
    H-I. SIN对CFA处理大鼠脊髓和DRG中IL-1β和TNF-αmRNA水平的作用。
    J-K. SIN对CFA处理大鼠血清中炎症细胞因子IL-1β和TNF-α水平的作用。


图5:青藤碱(SIN)通过介导P2X2R/ERK1/2通路,改善CFA诱导大鼠的疼痛信号。
A-D. SIN对CFA处理大鼠脊髓和DRG中P2X2R阳性信号面积的作用。
E. SIN对CFA处理大鼠脊髓和DRG中P2X2R mRNA水平的作用。
F. Western blot。
G. SIN对CFA处理大鼠脊髓和DRG中P2X2R蛋白表达的作用。

  1. SIN对CFA处理大鼠脊髓和DRG中磷酸化ERK1/2(p-ERK1/2)蛋白表达的作用。

I-K. P2X2R蛋白表达与疼痛行为之间的相关性分析。

(5)青藤碱通过P2X2R/ERK1/2轴调控小胶质细胞中的钙内流

图6:青藤碱(SIN)通过P2X2R/ERK1/2通路减少钙内流,从而调控LPS诱导BV2细胞信号。

A-B. A317491和BZATP对BV2细胞的细胞毒性。

C-G. SIN对TNF-α水平、TNF-α mRNA、NO浓度以及iNOS和P2X2R mRNA水平的作用。

H-K. SIN对iNOS、P2X2R、NMDAR2B和p-ERK1/2蛋白水平的作用。

L. 细胞内Ca2+的相对荧光强度。

M. BV2细胞Western blot条带图。

N. 不同处理组BV2细胞的代表性钙成像显微照片。

(6)青藤碱通过增加P2X2R的DNA甲基化水平以调控其表达

研究团队在THP-1细胞中通过全基因组甲基化测序发现,SIN可以调控P2X2R基因的甲基化水平,减少其表达。为验证这一机制在神经炎症模型中的适用性,研究在BV2细胞中采用DNA甲基转移酶抑制剂5-AzaC处理(导致全基因组甲基化水平显著降低)。结果显示,5-AzaC单独处理可整体降低甲基化水平,导致P2X2R表达较模型组进一步升高;而与SIN单独处理相比,SIN联合5-AzaC介导P2X2R mRNA水平显著升高,并呈现蛋白表达恢复趋势,表明SIN通过DNA甲基化发挥作用。进一步的靶向亚硫酸盐测序(AmpBS/Target-BS)在BV2细胞中鉴定出P2rx2位点上4个差异甲基化区域(DMRs),包含多个CpG位点。与对照组相比,LPS刺激导致这些区域CpG位点甲基化水平显著下降;而SIN处理则拮抗效应,相对于LPS模型组显著提高了P2X2R基因启动子区域多个CpG位点的甲基化水平。上述结果表明青藤碱通过提高P2X2R基因的DNA甲基化水平以抑制其转录和表达。

图7:青藤碱对P2X2R的调控作用与DNA甲基化水平升高相关。

  1. THP-1细胞中P2X2R基因的甲基化测序结果。
  2. P2X2R甲基化标签计数。
  3. BV2细胞的Western blot。
  4. 5-Azac处理后BV2细胞中P2X2R蛋白和mRNA水平变化。
  5. P2X2基因差异甲基化区域(DMRs)的UCSC可视化结果。
  6. SIN处理的BV2细胞中P2X2基因差异甲基化区域内CG位点的甲基化水平。

(7)青藤碱通过DNMT1介导P2X2R抑制

图8:青藤碱(SIN)通过特异性上调DNMT1介导P2X2R表达抑制。

A-D. SIN对P2X2R、DNMT1、DNMT3A和DNMT3B mRNA水平的作用。

E-H. SIN对P2X2R、DNMT1、DNMT3A和DNMT3B蛋白水平的作用。

  1. BV2细胞的Western blot条带。

J-L. siRNA转染后不同组中DNMT1、DNMT3A和DNMT3B mRNA水平变化。

M-O. 敲低DNMTs家族后不同组中P2X2R mRNA水平变化。

(8)计算分析支持DNMT1介导P2rx2增强子位点选择性甲基化

图9:DNMT1在P2rx2增强子区域位点选择性的计算分析。

  1. DNMT1周围序列偏好性评分在87个CpG位点上的分布,分为四个等级(高、中高、中低、低)。偏好性评分存在7倍差异,支持位点选择性甲基化的可能性。
  2. 在53个BV2细胞可测得的CpG位点上,DNMT1偏好性评分与实验甲基化变化交叉验证散点图。

结论和启示

本研究通过体内和体外模型的行为学、生物功能学、表观遗传学等分析揭示,青藤碱(SIN)通过上调DNMT1,诱导P2X2R基因启动子区域发生高甲基化,转录水平沉默P2X2R,减少下游ERK1/2信号激活和钙内流,最终缓解慢性炎症性疼痛。DNMT1是SIN发挥此表观遗传镇痛效应的特异性必需效应分子,确立了“SIN–DNMT1–P2X2R”作为一条全新的、非阿片类镇痛通路。

启示:

  • P2X2R及其表观遗传调控因子DNMT1,可作为开发非成瘾性、精准镇痛药物新靶点。
  • 研究为青藤碱提供全新、深入的分子机制解释,为其更广泛临床应用提供理论支撑。
  • 揭示通过靶向特定基因DNA甲基化状态来治疗慢性疼痛前景,助力扩展表观遗传学药物在慢性疼痛管理中的应用。

DNA甲基化整体研究方案

DNA甲基化是一种表观遗传修饰,指DNA分子在DNA甲基转移酶的作用下将甲基选择性地添加到特定碱基上的过程。主要发生在胞嘧啶的CpG位点,也可以在非CpG位点和CpG岛中发生。DNA甲基化参与调控基因表达、X染色体失活、基因印记、胚胎发育、细胞分化、肿瘤发生以及维持基因组稳定性。

 

参考文献:

Li QL, …, Dong Y, Xie Y, Yao YD, Zhou H. Sinomenine alleviates chronic inflammatory pain through DNA methyltransferase 1-mediated DNA methylation of the P2X2 purinergic receptor: an epigenetic mechanism of analgesia. Phytomedicine. 2026 Aug 5;160:158692.doi: 10.1016/j.phymed.2026.158692.

相关阅读:

CSC(IF20.5):剑桥大学团队利用微量WGBS等揭示DNMT3L在胎盘发育中的DNA甲基化调控机制

Cell|易基因微量DNA甲基化测序助力中国科学家成功构建胚胎干细胞嵌合体猴,登上《细胞》封面

项目文章:山东大学基础医学院李雷教授团队微量WGBS揭示DNA甲基化调控斑马鱼造血干细胞发育的表观遗传机制

项目文章|Mol Ther/IF12:广医二院微创介入科团队RRBS等揭示DNA甲基化在肿瘤治疗热应激研究中的关键作用

项目文章|Cell Rep:RRBS揭示MOF对UHRF1乙酰化修饰是DNA甲基化维持的关键调控机制

项目文章|Redox Biol/IF16.2:陆军军医大学刘晋祎/曹佳团队DNA甲基化多组学分析揭示父代暴露的表观遗传代际和跨代传递机制

项目文章|RRBS揭示中药材滇重楼DNA甲基化变化及花粉调控种子休眠的表观遗传机制

项目文章|基于dRRBS技术的精液DNA甲基化年龄预测:全基因组标记鉴定和模型开发

项目文章|Nature子刊:RRBS等揭示IDH1-R132H突变通过DNA甲基化加剧顺铂诱导肾毒性

技术推介 | 简化基因组甲基化测序研究解决方案

posted @ 2026-08-25 11:28  深圳市易基因科技  阅读(11)  评论(0)    收藏  举报