scanpy中常用函数

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1.scanpy.pp.normalize_total

scanpy.pp.normalize_total(adata, target_sum=None, exclude_highly_expressed=False, 
max_fraction=0.05, key_added=None, layer=None, layers=None, layer_norm=None, inplace=True, copy=False)

• target_sum默认为None，经过归一化后，每个cell的total count都是归一化前的中值median。