摘要：fold change英文简称 : FC中文全称 : 倍性变化所属分类 : 生物科学词条简介 : 一种用于描述两个用于相比的对象数量差异的方法。例如，第一个样本和第二个样本的量是50/10，那么FC（Ratio）就是5，反之就是0.2。用这种方法分析微阵列的数据可以说明：1)从基因表达的绝对值而来的... 阅读全文

摘要：hardy-weinberg平衡:标准定义————如果一个种群符合下列条件:1.种群是极大的；2.种群个体间的交配是随机的,也就是说种群中每一个个体与种群中其他个体的交配机会是相等的；3.没有突变产生；4.种群之间不存在个体的迁移或基因交流；5.没有自然选择,那么,这个种群的基因频率(包括基因型频率... 阅读全文

摘要：单倍型，是单倍体基因型的简称，在遗传学上是指在同一染色体上进行共同遗传的多个基因座上等位基因的组合；通俗的说法就是若干个决定同一性状的紧密连锁的基因构成的基因型。按照某一指定基因座上基因重组发生的数量，单倍型甚至可以指至少两个基因座或整个染色体。与基因型的区别更进一步的讲，单倍型也是指一个染色单体里... 阅读全文

摘要：首先QTL是数量性状位点，比如身高是一个数量性状，其对应的控制基因的位点就是一个数量性状位点，而eQTL就是控制数量性状表达位点，即能控制数量性状基因（如身高基因）表达水平高低的那些基因的位点。数量性状基因座：控制数量性状的基因在基因组中的位置称数量性状基因座。常利用DNA分子标记技术对这些区域进行... 阅读全文

摘要：GWAS的数据形式：SNP数据，即各个SNP位点的aa,Aa,AA基因型与疾病状态（0正常，1患病）的样例-对照数据。在遗传流行病学上，全基因组关联研究（Genome Wide Association Studies,GWAS）是一种检测特定物种中不同个体间的全部或大部分基因，从而了解不同个体间的基... 阅读全文

摘要：具有遗传效应的DNA片段，是控制生物性状的基本遗传单位。结构基因基因中编码RNA或蛋白质的碱基序列。（1）原核生物结构基因：连续的，RNA合成不需要剪接加工；（2）真核生物结构基因：由外显子（编码序列)和内含子（非编码序列)两部分组成。非结构基因结构基因两侧的一段不编码的DNA片段(即侧翼序列)，参... 阅读全文

摘要：基本概念基因表达数据反映的是直接或间接测量得到的基因转录产物 mRNA在细胞中的丰度，这些数据可以用于分析哪些基因的表达发生了改变，基因之间有何相关性，在不同条件下基因的活动是如何受影响的。它们在医学临床诊断、药物疗效判断、揭示疾病发生机制等方面有重要的应用。目前，高通量检测基因组 mRNA 丰度的... 阅读全文

摘要：http://blog.sina.com.cn/s/blog_4c1f21000100utyx.htmlGO是Gene Ontology的简称，是生物学家为了衡量基因的功能而而发起的一个项目，从分子功能（molecular function）、生物学过程（biological process）和细胞... 阅读全文

摘要：外显率(penetrance)：外显率是指条件下，群体中某一基因型（通常在杂合子状态下）个体表现出相应表型的百分率。外显率等于100%时称为完全外显(complete penetranc)低于100%时则为不完全外显（incomplete penetranc)或外显不全。譬如说，玉米形成叶绿素的基因... 阅读全文

摘要：http://wenku.baidu.com/link?url=Fr_C7J5F4KusZTpZJUfuVfh4Bpyb9BAY7IQhWAOYirQJW0Oz-X3fI5r41aPHiQR8ENn9k6P1V9v1we6U2fe4IJIEci7Twg1Pma6n5ZC03k7在某一群体中，不同座位... 阅读全文

摘要：生存分析(Survival analysis)是指根据试验或调查得到的数据对生物或人的生存时间进行分析和推断，研究生存时间和结局与众多影响因素间关系及其程度大小的方法，也称 生存率分析或 存活率分析。 生存分析涉及有关疾病的愈合、死亡,或者器官的生长发育等时效性指标。 某些研究虽然与生存无关，但由于研究中随访资料常因失访等原因造成某些数据观察不完全,要用专门方法进行统计处理,这类方法起源于对寿命资料的统计分析,故也称为生存分析。生存率指个体能从起点活到时点t的概率，记为s（t）。要注意区别生存概率与生存率。生存概率是被观察对象活过某个时段的概率，而生存率是被观察对象从起点到t时刻多个时... 阅读全文

摘要：启动子http://baike.baidu.com/link?url=HMqaMY4mXusH--4hMu1p6P_XUzEve9lZhFGtxScnbb8Z9HaLYJ981eWxAuZt2iAP启动子是位于结构基因5'端上游的DNA序列，能活化RNA聚合酶，使之与模板DNA准确的结合并具有转录起始的特异性。起始时间和表达的程度。启动子（Promoters）就像“开关”，决定基因的活动。既然基因是成序列的核苷酸（nucleotides），那么启动子也应由DNA组成。启动子本身并不控制基因活动，而是通过与称为转录（transcription）因子的这种蛋白质（proteins）结合而控 阅读全文

摘要：染色体图距(mapdistance)即指两个基因在染色体图上距离的数量单位，它是以重组值1%去掉%号表示基因在染色体上的一个距离单位，即某基因间的距离为一个图距单位（mapunit,mu）。后人为了纪念现代遗传学的奠基人摩尔根，将图距单位称为"厘摩"（centimorgan,cM）。假设两基因a-b间的重组率为17%，即这两个基因相距17个图距单位(17cM)。1cM=1%交换值去掉%的数值。图距代表不完全连锁基因的交换率（值）。距离越大，交换率越大。 阅读全文

摘要：SNPs，全称是single nucleotide polymorphisms，SNPs等位基因频率的容易估计。采用混和样本估算等位基因的频率是种高效快速的策略。该策略的原理是：首先选择参考样本制作标准曲线，然后将待测的混和样本与标准曲线进行比较，根据所得信号的比例确定混和样本中各种等位基因的频率。SNPs概念 在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。即：在不同个体的同一条染色体或同一位点的核苷酸序列中，绝大多数核苷酸序列一致而只有一个碱基不同的现象。 只涉及到单个核苷酸碱基的变化，包括碱基的置换或颠换，插入和缺失等，但后两种少见。 从理论上来看每一个SNP 位点都可以... 阅读全文