第三天的HTML学习笔记涵盖了CSS基础知识的学习，包括样式表的引入方法、常用样式属性的应用以及CSS选择器的使用。在GitHub使用方面，学习了分支管理的概念和基本操作，以及如何处理合并冲突和进行Pull请求等进阶操作。