修改 bam 文件中染色体名 add chr
摘要：
$1=xxx.bam $2=xxx.chr.bam samtools view -H $1 | sed -e 's/SN:/SN:chr/g' | samtools reheader - $1 > $2 阅读全文
posted @ 2021-02-15 20:24 坐山雕 阅读(730) 评论(0) 推荐(0) 编辑
conda tophat STAR
摘要：
conda create -n tophat python = 2.7 conda install -c bioconda tophat conda install bowtie2 http://bowtie-bio.sourceforge.net/bowtie2/manual.shtml#the- 阅读全文
posted @ 2021-02-15 11:12 坐山雕 阅读(94) 评论(0) 推荐(0) 编辑