坐山雕

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修改 bam 文件中染色体名 add chr

$1=xxx.bam
$2=xxx.chr.bam

samtools view -H $1 | sed -e 's/SN:/SN:chr/g' | samtools reheader - $1 > $2

posted on 2021-02-15 20:24  坐山雕  阅读(736)  评论(0编辑  收藏  举报