随笔分类 -  R

摘要：分享一个制作弦图的R包：ggbio. 以下是一个简单的使用实例，效果图和代码如下。library(GenomicRanges)set.seed(1)N <- 100gr <- GRanges(seqnames = sample(c("chr1", "chr2", "chr3"), size = N,... 阅读全文

摘要：分组统计数据集是很常见的需求，R中也有相应的包支持数据集的分组统计。自己尝试了写了段R代码来完成分组统计数据集，支持公式，感觉用起来还算方便。代码分享在文章最后。使用方式:step 1: source('AggregateSummary.R')step 2: pastecs_summary(mpg+... 阅读全文

摘要：方差检验可以评估组间的差异。依据检验的结果，虽然你可以拒绝不存在差异的原假设，但方差检验并没有告诉你哪些组显著地与其他组有不同。Robert 在 《R in Action》一书中推荐了一个包-npmc: 该包提供了一种非参数多组比较程序。在控制犯第一类错误的概率（发现一个事实上并不存在的差异的概率） 阅读全文