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摘要： 生物信息学原理作业第四弹：DNA序列组装（贪婪算法） 原理：生物信息学（孙啸） 大致思想： 1. 找到权值最大的边； 2. 除去以最大权值边的起始顶点为起始顶点的边； 3. 除去以最大权值边为终点为终点的边； 4. 重复上述步骤，得到所有符合条件的边； 5. 拼接得到的边； 6. 加入孤立点（如果有 阅读全文

摘要： 生物信息原理作业第三弹：DNA序列局部比对，利用Smith–Waterman算法，python3.6代码实现。 实例以及原理均来自https://en.wikipedia.org/wiki/Smith%E2%80%93Waterman_algorithm。 DNA序列局部比对 转载请保留出处！ 感觉 阅读全文

摘要： 生物信息学原理作业第二弹：利用Needleman–Wunsch算法进行DNA序列全局比对。 具体原理：https://en.wikipedia.org/wiki/Needleman%E2%80%93Wunsch_algorithm。 利用Needleman–Wunsch算法进行DNA序列全局比对 转 阅读全文

摘要： 最近在上生物信息学原理，打算记录一些课上的作业。第一次作业：如题。 基本思路： 1.从GFF中读取CDS的起始终止位置以及正负链信息。GFF格式见 http://blog.sina.com.cn/s/blog_8a4f556e0102yd3l.html. 2.利用起始/终止位置等信息从FNA文件中提 阅读全文

摘要： 在B站看到一个up发的病名为爱的钢琴曲，感觉很好听，然后当然是要加入歌单啊。然而不知道怎么转换成mp3，找来找去找到了EFFmpeg 这篇只是达到了我简单的需求，以后可能会有EFFmpeg更详细的使用案例。下面开始了。 一、下载B站视频， 链接：病名为爱 下载之后是 .blv 格式（我的手机是这个格 阅读全文

摘要： 昨天学了一下R语言dplyr包，处理数据框还是很好用的。记录一下免得我忘记了... 先写一篇入门的，以后有空再写一篇详细的用法。 阅读全文