2018年12月26日

ChIP-seq 学习内容
摘要： chip-seq 流程图 书籍资料 工具 UCSU 安装 使用 原理 手册 Swiss在线分析工具 短序列比对工具 BWA 流程 格式处理 序列比对 peak-calling motif 可视化 输出文档 上下游分析 chip-seq 流程图 【怪毛匠子】 【独家整理-怪毛匠子】 书籍资料 生物信息 阅读全文
posted @ 2018-12-26 20:59 左筱弦 阅读(625) 评论(0) 推荐(0)
 
ChIP-seq motif ROC 相关资料
摘要： 【怪毛匠子】独家整理 不可以转载 MEME工具 http://meme-suite.org DNA motif 搜索算法总结 http://www.bbioo.com/lifesciences/40-115984-1.html online tools http://chipseek.cgu.edu 阅读全文
posted @ 2018-12-26 20:55 左筱弦 阅读(230) 评论(0) 推荐(0)
 
single-cell RNA-seq 工具大全
摘要： 【怪毛匠子-整理】 awesome-single-cell List of software packages (and the people developing these methods) for single-cell data analysis, including RNA-seq, AT 阅读全文
posted @ 2018-12-26 17:54 左筱弦 阅读(1544) 评论(0) 推荐(0)
 

2018年5月19日

Python 判断是否可以转化为浮点数及其他数字类型
摘要： Python中出现ValueError: could not convert string to float:应该怎么处理 感谢来源 https://blog.csdn.net/u010299224/article/details/50787427 阅读全文
posted @ 2018-05-19 22:00 左筱弦 阅读(3065) 评论(0) 推荐(0)
 

2018年4月17日

pacbio bax.h5文件处理及ccs计算
摘要： 1.NCBI文件格式如下： 2.格式转换 (1) bas.h5 -> ccs source /share/nas2/genome/biosoft/smrtanalysis/2.3.0/smrtanalysis/current/etc/setup.sh bash5tools.py --readType 阅读全文
posted @ 2018-04-17 09:06 左筱弦 阅读(854) 评论(0) 推荐(0)
 

2018年1月31日

安装pitchpork 及 pacbioscience 的问题及解决
摘要： 1. error while loading shared libraries: libpbbam.so: cannot open shared 解决： find -name libpbbam.so sudo cp libpbbam.so /usr/bin 2.no such file or *** 阅读全文
posted @ 2018-01-31 17:32 左筱弦 阅读(173) 评论(0) 推荐(0)
 

2018年1月30日

单细胞参考文献 single cell
摘要： 许多分析软件 ： https://github.com/seandavi/awesome-single-cell#software-packages Smart-seq、CEL-seq、SCRB-seq和Drop-seq。Smart-seqSMART（Switching mechanism at 5 阅读全文
posted @ 2018-01-30 20:39 左筱弦 阅读(1224) 评论(0) 推荐(0)
 
基因的各种名称-请阅后随便评论个信息哦！
摘要： 基因基本信息 格式： 中文名（英文名） 示例 基因简称(symbol) TSPAN6 基因种类(locus group) protein-coding gene 同源简称(alias symbol) T245|TSPAN-6 基因曾用简称(prev symbol) TM4SF6 基因曾用名称(pre 阅读全文
posted @ 2018-01-30 20:13 左筱弦 阅读(2572) 评论(0) 推荐(0)