10 2018 档案

缺少libz.so
摘要：R CMD INSTALL --configure-args='CPPFLAGS='-I/data/itmll/zhzheng/tools/lib/zlib-1.2.11/include'' --configure-args='LDFLAGS='-L/data/itmll/zhzheng/tools/lib/zlib-1.2.11/lib'' ShortRead 阅读全文
posted @ 2018-10-19 23:02 ZzzzHong 阅读(867) 评论(0) 推荐(0)
R常用包
摘要：visualization toolkits for genomic data:ggbio,Gviz 1.genomation: a toolkit for annotation and in bulk visualization of genomic intervals (scored or un 阅读全文
posted @ 2018-10-16 19:57 ZzzzHong 阅读(271) 评论(0) 推荐(0)
annotate(ggplot2)
摘要：ggplot2中的annotate可以在已有图形基础上，添加任意几何对象（如rect,pointrange，text等） 上图最底层的长方形就是用annotate制作出来的（代码来自于Guitar包） 阅读全文
posted @ 2018-10-10 21:14 ZzzzHong 阅读(5575) 评论(1) 推荐(0)
常用工具
摘要：samtools :处理sam和bam文件 deeptools： bedtools：bed文件操作 RSeQC：RNAseq数据处理 阅读全文
posted @ 2018-10-10 20:13 ZzzzHong 阅读(103) 评论(0) 推荐(0)