09 2018 档案

摘要:1.AnnotationDb-objects 是R中所有注释包的最基础的class,可用于各种数据库中ID转换,常用的三个函数select, columns和keys,saveDb(保存AnnotationDb object),loadDb,species(shows the genus and s 阅读全文
posted @ 2018-09-20 22:24 ZzzzHong 阅读(240) 评论(0) 推荐(0)
摘要:1.用自己的gtf文件构建txdb数据结构,用于下游分析(The TxDb class is a container for storing transcript annotations) 2.提取transcripts、exons、genes、promoters and so on 阅读全文
posted @ 2018-09-20 22:14 ZzzzHong 阅读(787) 评论(0) 推荐(0)
摘要:1.同时选择几种颜色:rainbow()、heat.colors、terrain.colors、topo.colors、cm.colors 阅读全文
posted @ 2018-09-20 21:56 ZzzzHong 阅读(139) 评论(0) 推荐(0)
摘要:CHIPQCs是一款好用的分析chipseq测序质量的软件,但是在说明文档中,作者有很些东西没有提到,在真正使用过程中,很从一出错。1.bam文件必须是sort过的文件,在同一目录下,还需要bam文件sort后的bam文件存在,否则会报错 阅读全文
posted @ 2018-09-11 21:22 ZzzzHong 阅读(1029) 评论(0) 推荐(0)