04 2017 档案

在一个终端后台运行的进程在新的终端中使用job不会被发现
摘要：我在一个终端后台运行了一个程序。之后由于工作需要又新开了一个新的终端。在新的终端中，我想查看后台程序的运行状态，输入jobs时，发现没有后台任务运行。难道我的程序死掉了？我接着top了下，发现我的后台程序是有在运行的。ps下发现也是不能发现这个后台任务的。但为什么jobs和ps时没有后台任务呢？我又 阅读全文
posted @ 2017-04-25 17:40 ZzzzHong 阅读(454) 评论(0) 推荐(0)
在ubuntu上安装pyenv出现的问题
摘要：1.安装完pyenv时，并没有出现问题。但在安装python3.6.1时报错： 这是因为缺少Pyenv依赖的包。查看官方的wiki(https://github.com/pyenv/pyenv/wiki/Common-build-problems),发现是需要先安装依赖包 2.在安装依赖包的过程中发 阅读全文
posted @ 2017-04-24 19:58 ZzzzHong 阅读(960) 评论(0) 推荐(0)
.bashrc:16: command not found: shopt配置环境变量时出错
摘要：使用另一台装的biolinux系统的文件时，想更改下环境变量，习惯性地在.bashrc文件中进行了配置。结果出现了上面的错误。 谷歌了下，biolinux系统默认的shell是zsh. echo $Shell发现默认的确实是zsh。于是将环境变量在.zshrc中配置后source，成功。 阅读全文
posted @ 2017-04-24 16:57 ZzzzHong 阅读(13447) 评论(0) 推荐(1)
precmd:6: job table full or recursion limit exceeded
摘要：使用GDC Data Transfer Tool下载10999个isoforms.quantification.txt文件时，写了shell循环的小脚本： 发现后面出现了一个提示： 总结了下：nohup进程的数量和后台运行的数量有上限，大概是1000个，我的任务有10999个。超出限制会出现上述提示 阅读全文
posted @ 2017-04-24 11:23 ZzzzHong 阅读(1089) 评论(0) 推荐(0)
ValueError: 'format' in __slots__ conflicts with class variable
摘要：今天在安装ATCG的GDC Data Transfer Tool 软件过程中，安装几个依赖的python包时出现以上错误。大致估计可能是python版本的问题。我pip安装的是3.x的版本，这个包可能用的是2.x的版本。 用2.x的版本安装后报错问题解决 安装完成后运行./gdc-client命令时 阅读全文
posted @ 2017-04-24 08:30 ZzzzHong 阅读(2484) 评论(0) 推荐(0)
记录优雅的pythonic代码
摘要：记录平时学习中接触到的和网上看到的一些pythonic的方法，只为日后查询时候方便。 1.列表推导式： 2.生成器表达式（减少内存占用） 3.强大的内置函数zip，可遍历两个可迭代对象。在将行转换为列时特别有用。（但似乎zip函数在处理大的数据时速度会比较慢） 4.*用于解构可迭代对象 当一个函数， 阅读全文
posted @ 2017-04-23 12:03 ZzzzHong 阅读(323) 评论(0) 推荐(0)
记录python学习过程中的一些小心得
摘要：1.python中一切皆对象，内置数据结构也是对象。处理一个对象就是利用它带有的方法和属性，对该对象进行处理，一步步达到我们想要的结果。 2.编程时，先构思好我们处理的对象是什么，具有哪些属性和方法，我们的输出结果是什么对象。 3.python中引号（''或""）表示字符串，方括号（[]）表示列表， 阅读全文
posted @ 2017-04-23 10:33 ZzzzHong 阅读(476) 评论(0) 推荐(0)
关于理解python类的小题
摘要：今天看了python部落翻译的一篇《一道python类的小题》文章，感觉挺有启发性，记录下来： 输出结果： 这里首先需要理解是，一、python程序的运行规则是一行一行依次执行的。二、python中类和函数的运行方式是有区别的。函数只有在调用时才会被执行（即运行内部的代码），在定义时并没有执行。而类 阅读全文
posted @ 2017-04-23 10:11 ZzzzHong 阅读(465) 评论(0) 推荐(0)