2019年12月17日
bioMart进行基因id的转换
摘要： 1.bioMart包的介绍 bioMart包是一个连接bioMart数据库的R语言接口，能通过这个软件包自由连接到bioMart数据库，这个包可以做以下几个工作： 1.查找某个基因在染色体上的位置。反之，给定染色体每一区间，返回该区间的基因； 2.通过EntrezGene的ID查找到相关序列的GO注 阅读全文
posted @ 2019-12-17 15:40 sryjm 阅读(17705) 评论(0) 推荐(0)
2019年12月10日
liftover-基因坐标的转换
摘要： liftover的介绍 人类基因组有不同的版本，目前用的最多的是hg38和hg19，为了将不同版本的染色体上的位置一一对应，UCSC出了这款工具liftOver，官方的定义是： This tool converts genome coordinates and genome annotation f 阅读全文
posted @ 2019-12-10 21:51 sryjm 阅读(7891) 评论(1) 推荐(0)