R ggplot2 翻转坐标
摘要：
p <- ggplot(mpg, aes(class, hwy)) p + geom_boxplot() p + geom_boxplot() + coord_flip() 阅读全文
R ggplot2 改变颜色
摘要：
p<-ggplot(iris,aes(Petal.Length,Petal.Width,color=Species))+geom_point()cols=c("red","green","blue") scale_colour_manual和scale_fill_manual用法相同更改颜色和leg 阅读全文
SNP密度分布模式
摘要：
1. window=100k，step=2k 统计每个window的snp密度，然后用mixtools的normalmixEM（两个组分的混合模型）统计snp的分布模式。 R command： library(mixtools) SNPdensity=read.table("snp.density. 阅读全文
perl 如何匹配ASCII码以及ASCII码转换
摘要：
匹配ASCII码: /[:ascii:]/ ASCII码转换为数字: ord() 数字转换为ASCII码: chr() 阅读全文
如何在window下查看文件的md5
摘要：
软件的话可以用Hash 不用软件，可以用window自带的命令行，首先在一个目录下按住Shift点击鼠标右键，调出CMD界面（或者直接win+R，cmd），命令行如下： certutil -hashfile file MD5 file可以给绝对路径，也可以给相对路径 阅读全文
ABySS非root权限安装
摘要：
本文转自 http://yangl.net/2015/11/12/abyss_install/ ABySS: ABySS is a de novo, parallel, paired-end sequence assembler that is designed for short reads. T 阅读全文
perl use FileHandle;打开多个文件
摘要：
use FileHandle;my %fh; my @filehandlename=("A","B","C"); ##文件句柄的名字； for my $filehandlename (@filehandlename){ $fh{$filehandlename}=FileHandle->new("> 阅读全文
2>&1 linux
摘要：
2>&1使用2>&1使用一 相关知识1）默认地，标准的输入为键盘，但是也可以来自文件或管道（pipe |）。2）默认地，标准的输出为终端（terminal)，但是也可以重定向到文件，管道或后引号（backquotes `）。3) 默认地，标准的错误输出到终端，但是也可以重定向到文件。4）标准的输入，输出和错误输出分别表示为STDIN,STDOUT,STDERR，也可以用0，1，2来表示。5）其实除了以上常用的3中文件描述符，还有3~9也可以作为文件描述符。3~9你可以认为是执行某个地方的文件描述符，常被用来作为临时的中间描述符。二 实例1）command 2> 阅读全文
fastq-dump 报错 解决方案
摘要：
命令行：~/tools/sratoolkit/sratoolkit.2.3.2-5-centos_linux64/bin/fastq-dump --split-spot --gzip rhesus_b_heart.sra报错信息:2013-09-11T05:02:11 fastq-dump.2.3.2 err: name not found while resolving tree within virtual file system module - failed to open 'rhesus_b_heart.sra'解决方法：找不到rhesus_b_heart.sra，就 阅读全文
sort -k 详解
摘要：
本原创文章属于《Linux大棚》博客，博客地址为http://roclinux.cn。文章作者为rocrocket。为了防止某些网站的恶性转载，特在每篇文章前加入此信息，还望读者体谅。===[正文开始]有时候学习脚本，你会发现sort命令后面跟了一堆类似-k1,2，或者-k1.2 -k3.4的东东，有些匪夷所思。今天，我们就来搞定它—-k选项！1 准备素材$ cat facebook.txtgoogle 110 5000baidu 100 5000guge 50 3000sohu 100 4500第一个域是公司名称，第二个域是公司人数，第三个域是员工平均工资。（除了公司名称，其他的别信，都瞎写 阅读全文