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摘要: 生物数据库 生物数据库是收集自科学实验、出版文献、高通量实验技术和计算分析等生命科学信息库,它包含来自基因组学、蛋白质组学、代谢组学、微阵列基因表达和系统发育学等领域的信息。 生物数据库大致可分为序列、结构和功能数据库。序列数据库储存核酸和蛋白质序列;结构数据库储存RNA和蛋白质的结构信息;功能数据 阅读全文
posted @ 2018-08-26 20:22 青蛙快飞 阅读(5621) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 如何计算每个基因的覆盖度与深度,有多种方法可以完成。如下演示使用samtools depth命令方法 1. 数据下载 1.1 Fastq文件下载 从NCBI下载Illumina Hiseq X Ten平台的RNA-Seq数据SRR7751429信息如上图所示。 1.1.1 使用wget命令(sra- 阅读全文
posted @ 2018-08-26 09:57 青蛙快飞 阅读(10479) 评论(0) 推荐(0)