2018年11月21日
Bioinfo online workshop
摘要： http://icb.med.cornell.edu/index.html%3Fpage_id=2068.html 1. Datacamp https://www.datacamp.com/courses/chip-seq-workflows-in-r 阅读全文
posted @ 2018-11-21 21:20 xiaoxiaoxiaoxue 阅读(122) 评论(0) 推荐(0) 编辑
RNA-seq标准化
摘要： 你的 heatmap 可能用错数据了 （组间表达量标准化） http://www.genek.tv/article/24 RNA-seq的标准化方法罗列 https://www.jianshu.com/p/2a52845cfa5d 当我们在说RNA-seq reads count标准化时，其实在说什 阅读全文
posted @ 2018-11-21 21:10 xiaoxiaoxiaoxue 阅读(844) 评论(0) 推荐(0) 编辑
RNA-seq workflow
摘要： SRAtoolkit download .fa http://www.genomicdataanalysis.com/genomicdatatype/rna-seq/ 阅读全文
posted @ 2018-11-21 21:08 xiaoxiaoxiaoxue 阅读(184) 评论(0) 推荐(0) 编辑
HTseq计算表达量
摘要： http://www.chenlianfu.com/?p=2438 阅读全文
posted @ 2018-11-21 15:26 xiaoxiaoxiaoxue 阅读(307) 评论(0) 推荐(0) 编辑
2018年11月20日
import
摘要： https://www.cnblogs.com/yan-lei/p/7828871.html 阅读全文
posted @ 2018-11-20 20:19 xiaoxiaoxiaoxue 阅读(90) 评论(0) 推荐(0) 编辑
python头部 #!/usr/bin/env python
摘要： *.py运行： python *.py OR ./*.py 对于*.py其首行应标明 #!/usr/bin/env python，定义python解释器调用路径，对比#!/usr/bin/python，前者调用PATH中指定的第一个python路径，后者只能调用在usr/bin目录下的python解 阅读全文
posted @ 2018-11-20 19:20 xiaoxiaoxiaoxue 阅读(203) 评论(0) 推荐(0) 编辑
RNA-seq基本流程
摘要： https://www.2cto.com/net/201801/714420.html 阅读全文
posted @ 2018-11-20 16:24 xiaoxiaoxiaoxue 阅读(924) 评论(0) 推荐(0) 编辑
测序原理
摘要： 1. 高通量测序(highthroughput sequencing, HTS)/下一代测序（next generation sequencing, NGS）前世今生 ref: https://baijiahao.baidu.com/s?id=1612934763948082306&wfr=spid 阅读全文
posted @ 2018-11-20 16:08 xiaoxiaoxiaoxue 阅读(1531) 评论(0) 推荐(0) 编辑
for loop
摘要： https://www.cnblogs.com/EasonJim/p/8315939.html 阅读全文
posted @ 2018-11-20 11:07 xiaoxiaoxiaoxue 阅读(94) 评论(0) 推荐(0) 编辑
sed command
摘要： https://blog.csdn.net/solaraceboy/article/details/79272344 阅读全文
posted @ 2018-11-20 11:06 xiaoxiaoxiaoxue 阅读(83) 评论(0) 推荐(0) 编辑