2020年4月10日
limma, edgeR, deseq2,genefilter计算差异R包的foldchange方法差别
摘要： 差异计算对应生信分析非常重要 limma,genefilter 包计算差异,数据一定要转log, 因为 这两个包计算差异使用的方法是 mean(As)-mean(Bs) , 也计算是 logAmean-logBmean = log(Amean/Bmean) 这也是为什么这两个包算出来的结果直接是lo 阅读全文
posted @ 2020-04-10 23:55 xiaojikuaipao 阅读(2140) 评论(0) 推荐(0)
R apply如何熟练掌握
摘要： R语言里重要的三个函数我认为就是 apply, melt, dcast 掌握了才能入门R . m = data.frame(m = c(1,2,3,4,5,6),n=c(3,4,5,7,8,9),t=c(4,5,6,7,8,9)) h = function(x,c1,c2){ v1 = median 阅读全文
posted @ 2020-04-10 15:30 xiaojikuaipao 阅读(136) 评论(0) 推荐(0)