萧飞IDO

摘要：dN/dS 在遗传学中，Ka/Ks或者dN/dS表示的是异意替换（Ka）和同意替换（Ks）之间的比例。这个比例可以判断是否有选择压力作用于这个蛋白质编码基因。 不导致氨基酸改变的核苷酸变异我们称为同义突变，反之则称为非同义突变。一般认为，同义突变不受自然选择，而非同义突变则受到自然选择作用。在进化分 阅读全文

摘要：转自：http://www.cnblogs.com/emanlee/p/4316581.html samtools是一个用于操作sam和bam文件的工具合集。包含有许多命令。以下是常用命令的介绍 1. view view命令的主要功能是：将sam文件转换成bam文件；然后对bam文件进行各种操作，比 阅读全文

摘要：VarScan使用示例，如下： samtools mpileup -q35 -d8000 -f GBS_A909.fa M008_alignmen_F4.sort.bam >M008_alignmen_F4.sort.mpileup samtools mpileup -q35 -d8000 -f G 阅读全文

摘要：进程（process）和线程（thread）是操作系统的基本概念，但是它们比较抽象，不容易掌握。 最近，我读到一篇材料，发现有一个很好的类比，可以把它们解释地清晰易懂。 1. 计算机的核心是CPU，它承担了所有的计算任务。它就像一座工厂，时刻在运行。 2. 假定工厂的电力有限，一次只能供给一个车间使 阅读全文

摘要：源自：http://blog.csdn.net/hitabc141592/article/details/40150983 Method 1:修改/etc/ssh/sshd_config配置文件，设置ClientAliveCountMax值大一点，单位是分钟。然后重启ssh服务使生效：service 阅读全文

摘要：源自：http://sanwen.net/a/hirxmpo.html samtools是一系列处理bam和sam格式文件的应用程序集合，具有众多的功能。 首先呢，bam和sam文件主要是bwa、bowtie、tophat等序列比对工具产生的，这些软件我们后面会谈到。 软件下载安装： 地址：http 阅读全文