萧飞IDO

摘要：CLUSTAL 2.0.12 Multiple Sequence Alignments >> HELP NEW << NEW FEATURES/OPTIONS ==UPGMA== The UPGMA algorithm has been added to allow faster tree cons 阅读全文

摘要：简介 top命令是Linux下常用的性能分析工具，能够实时显示系统中各个进程的资源占用状况，类似于Windows的任务管理器。 top显示系统当前的进程和其他状况,是一个动态显示过程,即可以通过用户按键来不断刷新当前状态.如果在前台执行该命令,它将独占前台,直到用户终止该程序为止. 比较准确的说,t 阅读全文

摘要：The BLAST Databases Last updated on January 12, 2015 This document describes the BLAST databases available on the NCBI FTP site under the /blast/db di 阅读全文

摘要：1. Velvet的安装 Velvet用于基因组的de novo组装，支持各种原始数据，包括Illumina的short reads和454的long reads。 首先下载velvet的安装包，直接使用make命令来编译，即可获得可执行主程序velveth和velvetg。安装如下： 值得注意的是 阅读全文

摘要：Velvet简单介绍： velvet是一款常用的基因组拼接软件，与soapdenovo一起常用于二代测序数据的处理，相对于soapdenovo拼接的完整性更好。他能同时支持fasta、fastq格式的数据，同时支持多个文库的数据同时使用。 其工作的一般过程简化为：输入short read序列，排除错 阅读全文

摘要：1、环境变量(PATH) 在Linux中，在执行命令时，系统会按照PATH的设置，去每个PATH定义的路径下搜索执行文件，先搜索到的文件先执行。 我们知道查阅文件属性的指令ls 完整文件名为：/bin/ls(这是绝对路径)， 那你会不会觉得很奇怪："为什么我可以在任何地方执行/bin/ls这个指令呢 阅读全文

摘要：Converting a SAM file to a BAM file First, if you use the Unix command head test.sam The first 10 lines on your terminal after typing "head test.sam", 阅读全文

摘要：一、正则表达式特殊变量：1、$n :包含上次模式匹配的第n个子串2、$& :前一次成功模式匹配的字符串3、$` :前次匹配成功的子串之前的内容4、$’ :前次匹配成功的子串之后的内容5、$+ :前一次使用括号的模式匹配的字符串. 二、文件句柄特殊变量:1、$| :如果设置为零,在每次调用函数writ 阅读全文

摘要：perl中的INC变量中包含了所有的perl module的查找路径。 可以使用perl -V 来查看INC的值。 1）默认地INC如下： @INC: C:/Perl/site/lib C:/Perl/lib . 2）设置环境变量PERL5LIB来增加到INC，例如： set perl5lib=c: 阅读全文

摘要：转自：http://www.mike.org.cn/blog/index.php?load=read&id=643 Perl 到了第五版增加了模块的概念，用来提供面向对象编程的能力。这是 Perl 语言发展史上的一个里程碑。此后，广大自由软件爱好者开发了大量功能强大、构思精巧的 Perl 模块，极大 阅读全文

摘要：linux中df命令的功能是用来检查linux服务器的文件系统的磁盘空间占用情况。可以利用该命令来获取硬盘被占用了多少空间，目前还剩下多少空间等信息。 Usage: df [OPTION]... [FILE]...Show information about the file system on w 阅读全文

摘要：du命令 一、du的功能 `du` reports the amount of disk space used by the specified files and for each subdirectory (of directory arguments). with no arguments,` 阅读全文

摘要：什么是高通量测序 高通量测序技术（High-throughput sequencing，HTS）是对传统Sanger测序（称为一代测序技术）革命性的改变, 一次对几十万到几百万条核酸分子进行序列测定, 因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing，NGS )足见其划时代的改变, 同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可... 阅读全文