摘要： Mothur命令中文解释——Mothur中文简易教程这些是mothur H-Z的目前所有命令的说明的翻译，第二部分。（使用Ctrl+F搜索你所查命令）参看http://www.mothur.org/wiki/Category:Commands 页面上查阅的所有命令我查了一下网上的中文教程，似乎没有。现在国内使用Mothur的人还很少，不过国外有不少做生态的都用到mothur了。毕竟有很多都是命令行操作。前天我还搜到了一个印度人在网上发的询问帖子，想问哪里有关于mothur的简单教程呢，他说mothur官方网站的教程有点难，看不太懂。今天这些命令里有三个可能会比较常用，一个是help，就类似于L 阅读全文

摘要： Mothur命令教程从这个页面http://www.mothur.org/wiki/Category:Commands上查阅的所有命令，根据个人理解翻译了一下。个人能力有限，会有不当之处。A-G (查看时请用Ctrl+F快捷键)Align.check这个命令使你计算16S rRNA基因序列中潜在的错配碱基对数目。如果你对ARB(http://www.arb-home.de/)的编辑窗口熟悉的话，这与计算~，#，-和=这些符号的数目相同。用greengenes的二级结构图谱和esophagus dataset运行这个命令。要运行这个命令，你必须提供FASTA格式的序列文件。Align.seqs这 阅读全文