2024年12月15日
R：相对丰度计算脚本
摘要： # 清除所有变量 rm(list = ls()) # 设置工作目录 setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\machine learning\\Heatmap\\KEGG") # 读取txt文件 # 假设txt文件是以制表符分隔，并且第一行为列名 inpu 阅读全文
posted @ 2024-12-15 15:54 王哲MGG_AI 阅读(104) 评论(0) 推荐(0)
R：分类学等级解析与标准化脚本
摘要： rm(list = ls()) setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\machine learning\\Network") #设置工作目录 library(dplyr) library(tidyr) library(readr) # 读取文件 data 阅读全文
posted @ 2024-12-15 15:46 王哲MGG_AI 阅读(72) 评论(0) 推荐(0)
R : 数据行匹配与筛选脚本
摘要： # 清除工作空间 rm(list = ls()) # 设置工作目录 setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\machine learning\\Heatmap\\CAZy") # 读取数据 otu <- read.table("TPM.CAZy.raw.t 阅读全文
posted @ 2024-12-15 15:45 王哲MGG_AI 阅读(69) 评论(0) 推荐(0)
R：LASSO 回归特征筛选与路径分析脚本
摘要： # 清理环境和加载必要包 rm(list = ls()) setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\machine learning\\LASSO回归\\CAZy") # 设置工作目录 train <- read.table("matched_otu.txt 阅读全文
posted @ 2024-12-15 15:43 王哲MGG_AI 阅读(277) 评论(0) 推荐(1)
R：SVM-RFE特征筛选与分类性能分析脚本
摘要： # 清理环境和设置工作目录 rm(list = ls()) setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\machine learning\\SVM-RFE\\CAZy") set.seed(127) # 加载数据 input <- read.table("ma 阅读全文
posted @ 2024-12-15 15:42 王哲MGG_AI 阅读(552) 评论(0) 推荐(0)
R ：MetaCyc路径名称提取脚本
摘要： # 清空环境变量 rm(list = ls()) # 设置工作目录，请修改为你的文件实际路径 setwd("C:\\Users\\Administrator\\Desktop\\machine learning\\Heatmap\\MetaCyc") # 读取路径数据 Pathway_raw <- 阅读全文
posted @ 2024-12-15 15:40 王哲MGG_AI 阅读(71) 评论(0) 推荐(0)