摘要: 在DNA测序中,reads mapping方向指的是描绘short-reads(短序列)对于参考基因组的比对方向,即将短读序列与参考基因组进行比对时匹配的方向。 这个方向信息通常被编码为“+”或“-”,其中“+”表示reads的5'端与正向链的3'端相对应,“-”表示reads的5'端与负向链的3' 阅读全文
posted @ 2023-05-10 16:01 王哲MGG_AI 阅读(455) 评论(0) 推荐(0)
摘要: Phred质量分数是DNA测序数据中,用来评估碱基质量的一种标准化表示方法。它最初是由美国华盛顿大学的高通量测序专家Phred J.在1997年发表的论文中提出的。 Phred质量分数使用logarithmic scale(即对数刻度)来表示碱基质量值。一般取值范围为0-40之间,其中0表示最差的质 阅读全文
posted @ 2023-05-10 16:00 王哲MGG_AI 阅读(1338) 评论(1) 推荐(0)
摘要: 在DNA测序数据中,pair number通常指的是双端测序(paired-end sequencing)中的对应序列的编号。在双端测序中,一条DNA分子会被从两端进行测序,并生成两段相互对应的序列,这两段序列的编号称为pair number。 双端测序可以提供高质量的测序结果和更准确的基因组组装。 阅读全文
posted @ 2023-05-10 14:59 王哲MGG_AI 阅读(33) 评论(0) 推荐(0)