摘要：
1、简介 Prodigal是为细菌和古菌基因组进行蛋白编码基因预测的软件 ,其缩写源于PROkaryotic DYnamic Programming Genefinding ALgorithm,表示原核生物基因预测的动态规划算法。 最早在2007年，在美国能源部联合基因组研究所(DOE)的支持下，由 阅读全文
posted @ 2023-05-04 20:53
王哲MGG_AI
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摘要：
报错信息为： (base) [wz@localhost temp]$ python ./summarizeAbundance.py -i gene.count -m output -c '9,16,21' -s ',+,+*' -n raw -o eggnog/10t/wz/temp/./summa 阅读全文
posted @ 2023-05-04 16:50
王哲MGG_AI
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摘要：
这个命令是在linux系统中运行的sed命令，用于编辑文件 eggnog.ko.raw.txt，其中的-i选项表示直接修改原文件。该命令匹配每一行的开始位置（^）后面跟着"ko:"字符串的内容，并将其替换为空字符串，即删除该字符串。 在宏基因组分析过程中，可能需要对原始数据文件进行预处理和清洗，比如 阅读全文
posted @ 2023-05-04 16:41
王哲MGG_AI
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