王闯wangchuang2017

组装技术的新进展 New advances in sequence assembly.

摘要：组装技术的新进展 1、测序和组装很难想象今天距离提出测序和组装已经有40年啦。我们回头来看一下这个问题。 “With modern fast sequencing techniques and suitable computer programs it is now possible... 1、测阅读全文

posted @ 2019-05-14 15:30 王闯wangchuang2017 阅读(260) 评论(0) 推荐(0)

1. 基础知识 (直方图柱状图正态分布模型抽样分布 )

摘要：前言这个系列的笔记是StatQuest视频的学习笔记，我的这些笔记有时候会使用一些自己以前收录的数据，外加自己补充的一些笔记。此篇笔记是基础知识，视频教程的1-5。一.什么是直方图如果我们测量一批人的身高，他们的身高并不固定，因此我们先做一个x轴，从左到右身高依次增高，如下所示：此时，我们开阅读全文

posted @ 2018-11-17 11:00 王闯wangchuang2017 阅读(5641) 评论(0) 推荐(0)

评估转录组从头组装准确度的新方法

posted @ 2018-11-10 16:09 王闯wangchuang2017 阅读(336) 评论(0) 推荐(0)

FPKM与RPKM

摘要： FPKM与RPKM (2015-01-09 23:55:17) 转载▼ FPKM与RPKM 转载▼ 标签：转载转载原文地址：FPKM与RPKM作者：Fiona_72965 定义： FPKM：Fragment Per Kilobase of exon model per Million mapp 阅读全文

posted @ 2018-11-09 22:50 王闯wangchuang2017 阅读(532) 评论(0) 推荐(0)

转录组分析---Hisat2+StringTie+Ballgown使用

摘要：转录组分析 Hisat2+StringTie+Ballgown使用 (2016-10-10 08:14:45) 转载▼ 转录组分析 Hisat2+StringTie+Ballgown使用转载▼ 标签：生物信息学转录组生物信息学转录组 1.Hisat2建立基因组索引： First, usin 阅读全文

posted @ 2018-11-09 22:48 王闯wangchuang2017 阅读(5429) 评论(0) 推荐(0)

转录组差异表达分析小实战（二）

摘要：转录组差异表达分析小实战（二） Posted: 八月 14, 2017 Under: Transcriptomics By Kai no Comments 差异基因表达分析我按照前面的流程转录组差异表达分析小实战（一），将小鼠的4个样本又重新跑了一遍，从而获得一个新的count文件：mouse_a 阅读全文

posted @ 2018-11-09 21:35 王闯wangchuang2017 阅读(6114) 评论(0) 推荐(0)

单细胞RNA测序技术之入门指南

摘要：单细胞RNA测序技术之入门指南【字体：大中小】时间：2018年09月12日来源：生物通编辑推荐：在这个飞速发展的测序时代，DNA和RNA测序已经逐渐成为“实验室中的家常菜”。若要评选出目前最受欢迎的一道菜，那恐怕非单细胞RNA测序莫属。编辑推荐：在这个飞速发展的测序时代，DNA 阅读全文

posted @ 2018-10-22 19:23 王闯wangchuang2017 阅读(5444) 评论(0) 推荐(1)

畅想未来的测序

摘要：畅想未来的测序三代测序这几天代表公司参加了Pacbio测序在武汉召开的会议，收获很多，特意跟大家分享下。小编在学校学习的时候，由于就读于医科院校，老师经常会跟小编和小编的同学们讲，未来每个人都有一个基因身份... 这几天代表公司参加了Pacbio测序在武汉召开的会议，收获很多，特意跟大家分享下阅读全文

posted @ 2018-10-19 22:27 王闯wangchuang2017 阅读(219) 评论(0) 推荐(0)

简单理解RNA-seq

摘要：简单理解RNA-seq 刘小泽已关注 2018.10.17 23:51* 字数 1518 阅读 46评论 0喜欢 3 刘小泽已关注 2018.10.17 23:51* 字数 1518 阅读 46评论 0喜欢 3 2018.10.17 23:51* 字数 1518 阅读 46评论 0喜欢 3 今天阅读全文

posted @ 2018-10-19 20:27 王闯wangchuang2017 阅读(5481) 评论(1) 推荐(0)

NGS基础 - 高通量测序原理

摘要： NGS基础 - 高通量测序原理原创：赑屃生信宝典 2017-07-23 NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析、ChIP-seq分析、DNA甲基化分析、重测序分析五部分内容。 NGS基础系列文章包括高通量测序原理，测序数据获取和质量评估，常见文件格式解释和转换4部分。本文 (高通量测序原理阅读全文

posted @ 2018-10-19 18:28 王闯wangchuang2017 阅读(4777) 评论(0) 推荐(0)

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