摘要: 转载:http://blog.sina.com.cn/s/blog_4a0824490101hncz.html (1)/c表示把匹配不上的字符进行替换. $temp="AAAABCDEF"; $count=$temp=~tr/A/H/c; print "$temp\t$count\n"; 结果:AA 阅读全文
posted @ 2016-06-04 14:27 ^-馒头-^ 阅读(3337) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 参考资料:《数据探掘 R语言实战》 p65-P68 相关性越强圆形越窄,左倾斜(\)表示负相关,右倾斜(/)表示正相关,例如Temp3pm和Temp9am为正相关 col 设置椭圆填充颜色 type 设置显示上三角、下三角、全部显示(upper、lower、full) diag 逻辑值,是否显示主对 阅读全文
posted @ 2016-05-25 19:10 ^-馒头-^ 阅读(499) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 转载:http://www.omicshare.com/forum/thread-151-1-3219.html(出处: OmicShare Forum) 1. 准备工作 2. 进入NCBI的Batch Entrez 3. 检索 4. 检查 5. 下载 阅读全文
posted @ 2016-05-22 22:11 ^-馒头-^ 阅读(425) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 【NCBI教程】资源汇总整理 阅读全文
posted @ 2016-05-22 21:35 ^-馒头-^ 阅读(384) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: <!--[if !mso]> <style> v\:* {behavior:url(#default#VML);} o\:* {behavior:url(#default#VML);} w\:* {behavior:url(#default#VML);} .shape {behavior:url(# 阅读全文
posted @ 2016-05-22 21:18 ^-馒头-^ 阅读(2539) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 转载:http://www.dxy.cn/bbs/thread/22255190#22255190 可参考综述文章:A beginner’s guide to eukaryotic genome annotation (肖世俊添加) 基因组注释主要包括四个研究方向:重复序列的识别;非编码RNA的预测 阅读全文
posted @ 2016-05-16 22:24 ^-馒头-^ 阅读(1601) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 转载:http://blog.csdn.net/shmilyringpull/article/details/8135855 什么是高通量测序? 高通量测序技术(High-throughput sequencing,HTS)是对传统Sanger测序(称为一代测序技术)革命性的改变, 一次对几十万到几 阅读全文
posted @ 2016-05-16 22:21 ^-馒头-^ 阅读(1112) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 阅读全文
posted @ 2016-05-16 20:25 ^-馒头-^ 阅读(370) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: R和Rstudio的关系:java(jdk)和eclipse的关系 一、安装R软件 1. 下载对应版本的R:http://mirror.bjtu.edu.cn/cran/ 2. 点击“install R for the first time” 3. 点击"Download R ……" 安装R过程较为 阅读全文
posted @ 2016-05-16 00:07 ^-馒头-^ 阅读(777) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 目的: 1. 计算自定义模序在所有蛋白质的匹配位点和次数 2. 输出超过阈值的蛋白质序列到Hit_sequences.fasta 3. Hit_sequences.fasta中序列用小写字母,匹配用大写字母 4. 返回一个数据框,内容包存储ID、注释行(anno)括——、长度(len)、匹配位置(P 阅读全文
posted @ 2016-05-13 09:09 ^-馒头-^ 阅读(1597) 评论(0) 推荐(1) 编辑