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转载：http://blog.sina.com.cn/s/blog_4a0824490101hncz.html （1）/c表示把匹配不上的字符进行替换. $temp="AAAABCDEF"; $count=$temp=~tr/A/H/c; print "$temp\t$count\n"; 结果：AA 阅读全文
posted @ 2016-06-04 14:27
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参考资料：《数据探掘 R语言实战》 p65-P68 相关性越强圆形越窄，左倾斜（\）表示负相关，右倾斜（/）表示正相关，例如Temp3pm和Temp9am为正相关 col 设置椭圆填充颜色 type 设置显示上三角、下三角、全部显示（upper、lower、full） diag 逻辑值，是否显示主对 阅读全文
posted @ 2016-05-25 19:10
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转载：http://www.omicshare.com/forum/thread-151-1-3219.html(出处: OmicShare Forum) 1. 准备工作 2. 进入NCBI的Batch Entrez 3. 检索 4. 检查 5. 下载 阅读全文
posted @ 2016-05-22 22:11
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【NCBI教程】资源汇总整理 阅读全文
posted @ 2016-05-22 21:35
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<!--[if !mso]> <style> v\:* {behavior:url(#default#VML);} o\:* {behavior:url(#default#VML);} w\:* {behavior:url(#default#VML);} .shape {behavior:url(# 阅读全文
posted @ 2016-05-22 21:18
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转载：http://www.dxy.cn/bbs/thread/22255190#22255190 可参考综述文章：A beginner’s guide to eukaryotic genome annotation （肖世俊添加） 基因组注释主要包括四个研究方向：重复序列的识别；非编码RNA的预测 阅读全文
posted @ 2016-05-16 22:24
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转载：http://blog.csdn.net/shmilyringpull/article/details/8135855 什么是高通量测序？ 高通量测序技术（High-throughput sequencing，HTS）是对传统Sanger测序（称为一代测序技术）革命性的改变, 一次对几十万到几 阅读全文
posted @ 2016-05-16 22:21
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posted @ 2016-05-16 20:25
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R和Rstudio的关系：java(jdk)和eclipse的关系 一、安装R软件 1. 下载对应版本的R：http://mirror.bjtu.edu.cn/cran/ 2. 点击“install R for the first time” 3. 点击"Download R ……" 安装R过程较为 阅读全文
posted @ 2016-05-16 00:07
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目的： 1. 计算自定义模序在所有蛋白质的匹配位点和次数 2. 输出超过阈值的蛋白质序列到Hit_sequences.fasta 3. Hit_sequences.fasta中序列用小写字母，匹配用大写字母 4. 返回一个数据框，内容包存储ID、注释行(anno)括——、长度(len)、匹配位置（P 阅读全文
posted @ 2016-05-13 09:09
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