06 2016 档案

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posted @ 2016-06-25 21:04 ^-馒头-^ 阅读(220) 评论(0) 推荐(0)
摘要:转载:http://blog.sina.com.cn/s/blog_4af3f0d20100fq5i.html 短序列组装(Sequence assembly)几乎是近年来next-generation sequencing最热门的话题。简单来说,就是把基因组长长的序列打断(shotgun sequ 阅读全文
posted @ 2016-06-23 15:41 ^-馒头-^ 阅读(1684) 评论(0) 推荐(0)
摘要:转载:http://www.plob.org/2012/12/02/4927.html 一、序列文本的准备 构树之前先将目标基因序列都分别保存为txt文本文件中(或者把所有序列保存在同一个txt文本中,可以用“>基因名称”作为第一行,然后重起一行 编辑基因序列),序列只包含序列字母(ATCG或氨基酸 阅读全文
posted @ 2016-06-06 17:46 ^-馒头-^ 阅读(23805) 评论(0) 推荐(0)
摘要:file 指定读入的文件 header 是否有列名(默认无) seq 指定分隔符(空格、TAB、换行符、回车符) quote 制定包围字符型数据的字符。默认情况下,字符串可以被 " 或 ’ 括起,并且两种情况下,引号内部的字符都作为字符串的一部分。有效的引用字符(可能没有)的设置由参数 quote 阅读全文
posted @ 2016-06-05 13:48 ^-馒头-^ 阅读(20523) 评论(1) 推荐(0)
摘要:转载:http://blog.sina.com.cn/s/blog_4a0824490101hncz.html (1)/c表示把匹配不上的字符进行替换. $temp="AAAABCDEF"; $count=$temp=~tr/A/H/c; print "$temp\t$count\n"; 结果:AA 阅读全文
posted @ 2016-06-04 14:27 ^-馒头-^ 阅读(3506) 评论(0) 推荐(0)