01 2021 档案

摘要：生信技能树R语言部分学习笔记 1. 常用可视化R包 作图：base, ggplot2, ggpubr 拼图：par里的mfrow（基础包中图的拼接）, grid.arrange, cowplot, customLayout, patchwork 导出：pdf()等三段论, ggsave(), eof 阅读全文

摘要：生信技能树R语言部分学习笔记 dir() #列出工作目录下的文件 ls() #列出环境中的变量 #1. 认识csv格式 csv打开方式： (1)默认excel (2)记事本打开 (3)sublime（适用大文件） (4)R语言读取：读进R语言之后的数据是一个数据框，可赋值，变量名与文件名无必然联系， 阅读全文

摘要：生信技能树R语言部分学习笔记 学习用Rmarkdown来写代码，Rmarkdown可以将注释、代码、运行结构一起展示的一种工具。 #1. 函数与参数 (1)形式参数与实际参数 函数括号里面等号前面的是形式参数，等号后面的是实际参数。形式参数是函数作者设计的，可以不写；实际参数是使用者可以更改的。 ( 阅读全文

摘要：生信技能树R语言部分学习笔记 #03 数据框、矩阵和列表 ##3.1 数据结构简介 (1) Vector向量：一维 从1：100个整数中，随机取7个数，默认不放回取，如果要有放回取样，需要设置参数replace = TRUE > sample(1:100,7) [1] 38 80 74 96 63 阅读全文

摘要：生信技能树R语言部分学习笔记 诸事殚精竭虑者，终将一无所成。 腓特烈大帝 #01 R与Rstudio 在R中用新建R project来代替setwd(),方便管理工作目录（默认文件保存的位置）。 #02 数据类型和向量 数据类型分为：数值型(numeric)，字符型(character)，逻辑型(l 阅读全文

摘要：R bioconductor中的scRNAseq数据包是专门提供scRNA-seq数据的包。 #1.Introduction scRNA-seq包提供了一个方便的途径来获得公开的数据集，这些数据集是以SingleCellExperiment 格式存储的。 library(SingleCellExpe 阅读全文