linux命令行下使用R语言绘图

 

系统：centos 6.4 64bit

 

环境安装参考：http://hi.baidu.com/solohac/item/4a18e78f1bef9b5825ebd99c

 

在R语言中可以使用png()等函数生成图片，例如： png("aa.png")可以生成图片。

但是如果你是通过shell远程连接到系统上，可能会碰到如下错误：

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> png("aa.png") 错误于.External2(C_X11, paste("png::", filename, sep = ""), g$width,  :   无法打开PNG设备 此外: 警告信息： In png("aa.png") : 无法打开链结到X11显示''

 

分析：

 

打开R控制台，输入capabilities()，可以看到：

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> capabilities()     jpeg      png     tiff    tcltk      X11     aqua http/ftp  sockets    FALSE    FALSE    FALSE    FALSE    FALSE    FALSE     TRUE     TRUE   libxml     fifo   cledit    iconv      NLS  profmem    cairo     TRUE     TRUE     TRUE     TRUE     TRUE    FALSE    FALSE

可以看到png为false，因为生成图片需要X11，但是shell是没有X11的。

 

怎么解决：

1.在X11模式下执行R语言命令，也就是在linux的桌面。如果你只是在桌面上画画图，那选择这个方式就可以了。

2.不使用X11生成,使用 图形渲染库Cairo。比如我，需要用脚本，根据实时数据生成统计图，那么用这个方式就很方便。

 

 

安装：

 

启动R控制台

R

安装

1	install.packages("Cairo")

 

会让你选择安装镜像

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--- 在此連線階段时请选用CRAN的鏡子 --- CRAN mirror    1: 0-Cloud                       2: Argentina (La Plata)        3: Argentina (Mendoza)           4: Australia (Canberra)        5: Australia (Melbourne)         6: Austria                     7: Belgium                       8: Brazil (BA)                 9: Brazil (PR)                  10: Brazil (RJ)                11: Brazil (SP 1)                12: Brazil (SP 2)              13: Canada (BC)                  14: Canada (NS)                15: Canada (ON)                  16: Canada (QC 1)              17: Canada (QC 2)                18: Chile                      19: China (Beijing 1)            20: China (Beijing 2)  选一个北京的好了：20

 

安装出错

configure: error: Cannot find cairo.h! Please install cairo (http://www.cairographics.org/) and/or set CAIRO_CFLAGS/LIBS correspondingly.

 

所以我们需要先在系统中安装cairo库

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yum -y install cairo* libxt* 安装完成之后，重新执行：install.packages("Cairo") installing to /usr/local/lib64/R/library/Cairo/libs ** R ** preparing package for lazy loading ** help *** installing help indices ** building package indices ** testing if installed package can be loaded * DONE (Cairo)   下载的程序包在 ‘/tmp/RtmpNlGyf3/downloaded_packages’里 更新'.Library'里的HTML程序包列表 Making 'packages.html' ... 做完了。

 

安装成功。

 

加载Cairo后，查看支持：

 

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> library(Cairo) > Cairo.capabilities()    png   jpeg   tiff    pdf    svg     ps    x11    win raster   TRUE  FALSE  FALSE   TRUE   TRUE   TRUE   TRUE  FALSE   TRUE 说明已经支持用cairo生成图片了。 例如可以使用如下命令生成PNG： CairoPNG(file="out.png",width=800,height=480)

 

附上一个测试小程序，主要为了说明用法：

#vim test.r

 

library(Cairo)

CairoPNG(file="out.png",width=800,height=480)

plot(5,4)

 

保存后执行：

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[root@localhost ~]# Rscript test.r   R version 3.1.0 (2014-04-10) -- "Spring Dance" Copyright (C) 2014 The R Foundation for Statistical Computing Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit) > library(Cairo) > CairoPNG(file="out.png",width=800,height=480) > plot(5,4) >

 

 

在当前目录下可以看到生成了图片

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[root@localhost ~]# ll 总用量 84 -rw-r--r--. 1 root root  6832 5月  13 10:33 out.png -rw-r--r--. 1 root root    71 5月  13 10:32 test.r