摘要：HOMER 是一套用于Motif查找和二代数据分析的工具。HOMER 中的工具是使用Perl 和C++编写的，是Linux command line based。HOMER 这个软件是一个大杂烩，能解决几乎所有的高通量测序数据的分析。（这里，我们仅仅是介绍Motif查找这个功能） 1.HOMER软件 阅读全文

摘要：如何极大减少Seurat对象保存时间 Seurat R 包无疑目前大家进行单细胞分析最长用的包之一，Seurat分析时将每一步结果都存在了Seurat 对象的不同slots中，好处是计算的所有信息得以保留，然而同时也会造成文件过大，难以保存和读取。对于2万个细胞以下也许不成问题，但当细胞数超过10万 阅读全文