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摘要： 最近在使用 删除目录时报错了，这里记录下os操作文件或者目录的常用方法 递归删除文件或文件夹 文件的重命名 文件的删除 删除目录会报错： 创建目录 aaa必须存在才能创建成功 递归创建目录 存在就不会创建了 删除目录 删除aaa目录下的bbb目录 只能删除空目录，否则会报错 删除多级目录 若目录为空 阅读全文

摘要： 最近总是有需要单独对某一个类型的通路进行超几何分布的p值计算，这里记录一下python包的计算方法 使用scipy的stat里面的hypergeom.sf方法进行富集分析的p值计算 hsaxxxxx AA and Linoleic metabolism KEGG pathways Pathways 阅读全文

摘要： 本文并非原创，而是转载于薛宇博客，地址如下： 链接地址：http://blog.sciencenet.cn/blog 404304 834869.html 看看自己处于哪个阶段，时刻激励自己前进 前几天去南京参加两年一度的全国大会CCBSB2014，今年是第六届，见到许多熟识的前辈和老朋友，也结识了 阅读全文

摘要： 什么是docker Docker 是一个开源的应用容器引擎，让开发者可以打包他们的应用以及依赖包到一个可移植的容器中，然后发布到任何流行的 Linux 机器上，也可以实现虚拟化。容器是完全使用沙箱机制，相互之间不会有任何接口（类似 iPhone 的 App）。几乎没有性能开销,可以很容易地在机器和数 阅读全文

摘要： 近期在测试多样品的WES的过程中发现用HC得到gvcf之后，合并多个样品的gvcf文件的过程中，使用CombineGVCFs的过程中很慢，发现官网推荐使用GenomicsDBImport 用法如下： gatk GenomicsDBImport \ -V data/gvcfs/mother.g.vcf 阅读全文

摘要： 参考博客： https://blog.csdn.net/kxwinxp/article/details/78578492 https://blog.csdn.net/inslow/article/details/54177191 https://blog.csdn.net/kxwinxp/artic 阅读全文

摘要： 同步本地文件到服务器 rsync -zvrtopg --progress --delete test -e 'ssh -p 6665' yueyao@172.16.0.99:/media/sdb/user/yueyao/ 同步服务器到本地 rsync -zvrtopg --progress -e ' 阅读全文

摘要： 系统环境centos 6.5 使用root用户进行安装，此方法会将gcc安装至/usr/bin目录下 curl -Lks http://www.hop5.in/yum/el6/hop5.repo > /etc/yum.repos.d/hop5.repo yum install gcc gcc-g++ 阅读全文

摘要： WDL是什么？ WDL是由Broad Institute开发的一种流程开发语言，全称workflow description language，官方链接如下:https://software.broadinstitute.org/wdl/ WDL的编写 WDL有自己的语法规范，它是一种描述性语言，可 阅读全文

摘要： https://www.zhihu.com/question/20467170 参考了知乎的回答，以及wiki的解释，个人的理解如下： 归一化和标准化本质上都是对数据集特征的缩放，而wiki的解释中特征的缩放一般有四种不同的公式 Rescaling (min-max normalization) M 阅读全文