2008年5月21日

使用Python/BioPython解析BLAST结果

摘要: 在生物信息学中,对BLAST结果文件的解析是最为普遍的一个工作之一,在Perl中有BioPerl可以解析,而在Python中也有 BioPython,并且解析起来非常方便。由于BLAST的版本升级比较快,它的结果输出文件的格式有时也会相应变化,因此为了能正确的解析BLAST 结果,在做BLAST的时候使用'-m 7'参数,使输出结果保存为xml的格式,这是由于xml的格式很少随着BLAST的版本而... 阅读全文

posted @ 2008-05-21 12:34 屈武斌 阅读(4321) 评论(0) 推荐(0)

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