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2023年2月8日
20230111_每日学习记录
摘要： 20230111 今天发现下载smpdb的数据有点问题,没有下载完全并且感觉自己的思路错了.可能还是需要去做更多的事情来可视化.比如解析SBGN或者SBML. 想尝试一下自己改动一下PC合成的svg,再看看是否可以进一步更改. 阅读全文
posted @ 2023-02-08 14:31 Mo槑 阅读(68) 评论(0) 推荐(0)
20230131_每日学习记录
摘要： 20230131 使用下面的方法对一个字符串一次性的进行不同替换 s = 'one two one two one' print(s.translate(str.maketrans({'o': 'O', 't': 'T'}))) 阅读全文
posted @ 2023-02-08 14:31 Mo槑 阅读(14) 评论(0) 推荐(0)
20230201_每日学习记录
摘要： 20230201 在linux中启动rstdio: 使用conda把rstudio安装好后,想启动的话需要先激活相应的conda,再启动rstudio,不然会启动失败. 阅读全文
posted @ 2023-02-08 14:31 Mo槑 阅读(70) 评论(0) 推荐(0)
20230110_每日学习记录
摘要： 20230110 DESeq2使用的输入数据是counts, 而转录组可视化很多用的都是TPM 听报告:PM2.5 PM2.5是怎么影响 炎症反应 血液 通过嗅神经进入中枢神经 UK biobank数据量很大, 阅读全文
posted @ 2023-02-08 14:30 Mo槑 阅读(39) 评论(0) 推荐(0)
2023年1月4日
20230103_每日学习记录
摘要： 20230103 做多线程爬虫,需要有些对抗反扒机制的措施. 有些时候直接写多线程,比如python的multiprocessing,会发现抓不下来东西.这也可能是我的爬虫没写好.但是就是发现同样的代码,不使用多线程就可以抓下来.使用多线程就啥也抓不下来. 这次写爬虫发现了一个取巧的办法,就是反扒机 阅读全文
posted @ 2023-01-04 22:18 Mo槑 阅读(25) 评论(0) 推荐(0)
2022年12月29日
20221229_每日学习记录
摘要： 20221229 使用下面的命令可以对Linux的结果进行排序 ll -h | awk '{print \$5}' |sort |uniq -c python的pandas读取csv和筛选某一列中数据也在list中 import pandas as pd dataFrame = pd.read_cs 阅读全文
posted @ 2022-12-29 22:06 Mo槑 阅读(15) 评论(0) 推荐(0)
2022年12月6日
20221206_每日学习记录
摘要： 20221206 今天看了刘永鑫写的ImageGP包的代码和网站,感觉做的不错.代码是使用bash调用R的,可以学习一下,下面的操作 地址是这里 下面是.sh的用法说明的部分 usage() {..... ${txtbld}OPTIONS${txtrst}: #这部分是参数 -f Data file 阅读全文
posted @ 2022-12-06 21:55 Mo槑 阅读(24) 评论(0) 推荐(0)
2022年11月23日
代谢组数据分析方法
摘要： 今天归纳一下代谢组数据分析方法 峰检测:识别原始数据中的代谢物的色谱峰,这些峰用于定量.现在有很多方法进行峰检测,如Tautenhahn开发centWave,其采用小波变换的原理识别色谱峰，而由Conley等人开发的Massifquant采用卡尔曼滤波器(Kalman filter)的识别色谱峰。 阅读全文
posted @ 2022-11-23 14:37 Mo槑 阅读(625) 评论(0) 推荐(0)
2022年9月12日
读文献--综述Comparison and evaluation of pathway-level aggregation methods of gene expression data
摘要： 读文献--综述:Comparison and evaluation of pathway-leel aggregation methods of gene expression data Introduction Background 得到数据的功能性的理解集中于基因集的功能,比如pathways而 阅读全文
posted @ 2022-09-12 14:50 Mo槑 阅读(356) 评论(0) 推荐(0)
2022年9月11日
算法养成计划--day5
摘要： 20220911 昨天中秋节休息一天 第二题直接看答案，很巧妙的方法，充分的利用异或的性质来写循环。mark一下 第一题 nums[::2], nums[1::2] = nums[:n], nums[n:] 第二题 nums = [5,1,6] candidates = [0] for x in n 阅读全文
posted @ 2022-09-11 20:24 Mo槑 阅读(12) 评论(0) 推荐(0)
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