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2023年2月10日
结构变异(SV)检测
摘要: 接触过一段时间遗传变异检测,现有公认的 GATK 检测小变异(snv + indel)的 “最佳实践” ,但是对于结构变异(SV),尽管有相当多软件能进行 SV 检测,但在其目前业内没有共识的检测软件和流程。
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posted @ 2023-02-10 14:35 magower
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突变群体频率数据库(snv + indel)
摘要: 对于变异检测,通常每个样本都可以检测出许多变异,比如一个正常的全外可以检测 4w+ 个小变异(snv + indel), 而通常样本量多时,就有必要将所有检出的变异收集起来,用于后续的数据挖掘、变异查询工作。
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posted @ 2023-02-10 13:56 magower
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