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03 2019 档案
层次聚类
摘要:层次聚类分为:凝聚法和分裂法。 凝聚法: 假设有N个待聚类的样本,对于层次聚类来说,基本步骤就是: 1、(初始化)把每个样本归为一类,计算每两个类之间的距离,也就是样本与样本之间的相似度(杰卡德距离); 2、寻找各个类之间最近的两个类,把他们归为一类(这样类的总数就少了一个); 3、重新计算新生成的
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2019-03-25 15:44
luxliy
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盲源分离
摘要:ICA 属于一种盲源分离。 盲信号分离研究的信号模型主要有线性混合模型和卷积混合模型,盲源分离源信号线性混合是比较简单的一种混合形式,典型的BSS/ICA问题就是源于对独立源信号的线性混合过程的研究。 盲源分离 可以用来降噪。
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2019-03-25 15:14
luxliy
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各类分布----二项分布,泊松分布,负二项分布,gamma 分布,高斯分布,学生分布,Z分布
摘要:伯努利实验: 如果无穷随机变量序列 是独立同分布(i.i.d.)的,而且每个随机变量 都服从参数为p的伯努利分布,那么随机变量 就形成参数为p的一系列伯努利试验。同样,如果n个随机变量 独立同分布,并且都服从参数为p的伯努利分布,则随机变量 形成参数为p的n重伯努利试验。 伯努利试验是只有两种可能结
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2019-03-21 13:31
luxliy
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评价指标1--F1值和MSE
摘要:1,F1=2*(准确率*召回率)/(准确率+召回率) F1的值是精准率与召回率的调和平均数。F1的取值范围从0到1的数量越大,表明实现越理想。 Precision(精准率)=TP/(TP+FP) Recall(召回率)= TP/(TP+FN) 2,均方误差(MSE,Mean Square error
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2019-03-15 10:44
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Patchwork(2013年)--CNV检测方法流程
摘要:文章题目:Patchwork: allele-specific copy number analysis of whole-genome sequenced tumor tissue 特点: 可以检测配对样本,也可以检测带reference的tumor样本。但是没有考虑肿瘤异质性问题。使用DNAco
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2019-03-15 09:44
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