摘要：
类和实例类是对象创建实例的模板，而实例则是对象的实体。类使用class关键字定义：class MyClass: passpython中创建实例直接使用工厂函数（类名加上一对括号），和其他的语言使用new关键字有所不同：my_obj = MyClass()一般来说，类名以大写字母开头，而对象名则以小写字母或者下划线开头。实例化对象时，会执行类定义中的__init__()方法，该方法执行时包含实... 阅读全文
摘要：
同样作为动态语言，python的面相对像和ruby有很多类似的地方，这里还是推荐《Ruby元编程》一书来参考学习python的面向对象。然而python并不是纯面向对象设计，所以很多ruby种灵活的技巧在python中可能并不适用，但是这并不影响该书对python面向对象学习的借鉴意义。从类和实例开始，谈python2到python3类和实例是面向对象的基础，类是一个对象的定义，比如人类定义了人应... 阅读全文
摘要：
模块模块是python中的最高组织单元，在物理层面上，模块以文件存储，模块的文件名就是模块的名字.py，每个模块都有自己的名称空间。python按照路径搜索来查找模块文件，在PYTHONPATH环境变量中的路径为Python模块的搜索路径，通过sys.path属性可以看到模块搜索路径的列表，python按照这个列表的顺序对模块进行搜索，所以在路径列表前面的路径搜索到模块之后就不会继续搜索。由于该值... 阅读全文
摘要：
在python中，函数名也是一个变量，代表对一个函数内容的引用，意味着可以作为参数传入到其他函数中，根据这个特性，发散出装饰器、闭包等概念，并涉及到变量作用域等问题。函数python中函数操作符为()，在任何需要调用函数的地方都需要在函数名后面加()，表示调用该函数，否则的话仅仅表示一个函数对象，当然可以保存这个对象，或者将该函数对象传入到其他函数中，以供延迟调用。函数的参数分为按顺序确定的位置参... 阅读全文
摘要：
今天开始所有的工作脚本全都从perl转变到python，开发速度明显降低了不少，相信以后随着熟练度提升会好起来。贴一下今天一个工作代码，由于之前去一家小公司测序时，序列长度竟然都没有达到要求，为了之后的索赔事宜，写了个脚本统计所有序列的结果，主要包括总的reads数，bases数，和达到测序策略要求... 阅读全文
摘要：
地毯式地过语法终于快要结束了。。。Python中的常见异常1.NameError：尝试访问一个未初始化的变量2. ZeroDivisionError：除数为03. SyntaxError：Python解释器语法错误4. IndexError：请求的索引超出序列的范围5. KeyError：请求一个不存在的字典关键字6. IOError：输入、输出错误7. AttributeError：尝试访问未知... 阅读全文
摘要：
文件对象python中的文件操作和c语言比较类似，包括一些缓冲、偏移量的方式。文件对象可以通过open()、file()两个内建方法创建，两个方法并没有什么不同，使用方法和c语言中的fopen()类似：file_object = open(file_name, access_mode=‘r’, buffering=-1)其中access_mode表示打开方式，r表示只读，w表示只写，r+，w+表示... 阅读全文
摘要：
条件和其他语言类似，python中使用if...elif...else来形成分支，支持三目操作符 ？：，python中没有switch，但是缩进的特性让if...elif...else的结构同样便于阅读循环控制python中除了break，continue这两个一般的循环控制语句之外，还有一个pass，执行空操作。由于python的语法特性，添加pass可以留空某一个域，避免在调试过程中反复报错。... 阅读全文
摘要：
字典、集合两种基本类型都是通过映射的方式访问。字典python中的字典和perl中的哈希是很相似的，包括其重要的几条属性：1. 键值必须是唯一的2. 键值必须是可哈希的，也就是键值不能够是可变类型，比如列表、字典等3. 键是无序的，根据sorted()方法可以对其进行排序字典的创建：可以通过以下几种方式：dict1 = {’name’:’Lyon’,’age’:23,’gender’:’male'... 阅读全文
摘要：
列表、元组、字符串这些通过顺序访问的对象统称为序列。序列的标准操作符对于一般的序列对象，包括列表、元组、字符串，都具有以下的标准操作：1. element [not] in seq判断一个元素是否属于一个序列，返回一个布尔值；2. seq[ind] 获得下标为ind的元素3. seq[ind1:ind2:step] 获得一个切片，从ind1到ind2，步长为step的元素组成的新的序列，步长为负值... 阅读全文