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摘要: pandaseq是一款非常好用的序列拼接软件,项目传送:https://github.com/neufeld/pandaseq/ (编译安装前需要libtool-devel)所谓科技服务和科研态度有的时候真的不统一,在pandaseq拼接的时候,如果输出fastq文件,overlap部分,如果错配的... 阅读全文
posted @ 2015-08-06 16:54 Lyon2014 阅读(618) 评论(1) 推荐(0) 编辑
摘要: echo " ls *.$2 | while read file;do out=$( (grep -n $1 $file) ) [ -n \"$out\" ] && echo $file,$out;done">search.sh搜索:sh search.sh get_longest_overlap ... 阅读全文
posted @ 2015-08-06 11:50 Lyon2014 阅读(186) 评论(0) 推荐(0) 编辑